NPASS Compound

Structure

Physi-Chem Properties

Molecular Weight:	146.11
Volume:	149.27
LogP:	-3.603
LogD:	-1.5
LogS:	-0.519
# Rotatable Bonds:	5
TPSA:	89.34
# H-Bond Aceptor:	4
# H-Bond Donor:	5
# Rings:	0
# Heavy Atoms:	4

MedChem Properties

QED Drug-Likeness Score:	0.457
Synthetic Accessibility Score:	2.474
Fsp3:	0.833
Lipinski Rule-of-5:	Accepted
Pfizer Rule:	Accepted
GSK Rule:	Accepted
BMS Rule:	0
Golden Triangle Rule:	Rejected
Chelating Alert:	0
PAINS Alert:	0

ADMET Properties (ADMETlab2.0)

ADMET: Absorption

Caco-2 Permeability:	-6.156
MDCK Permeability:	0.005683773662894964
Pgp-inhibitor:	0.013
Pgp-substrate:	0.013
Human Intestinal Absorption (HIA):	0.232
20% Bioavailability (F20%):	0.003
30% Bioavailability (F30%):	0.003

ADMET: Distribution

Blood-Brain-Barrier Penetration (BBB):	0.294
Plasma Protein Binding (PPB):	5.992045879364014%
Volume Distribution (VD):	0.703
Pgp-substrate:	93.94527435302734%

ADMET: Metabolism

CYP1A2-inhibitor:	0.011
CYP1A2-substrate:	0.045
CYP2C19-inhibitor:	0.03
CYP2C19-substrate:	0.058
CYP2C9-inhibitor:	0.008
CYP2C9-substrate:	0.118
CYP2D6-inhibitor:	0.009
CYP2D6-substrate:	0.288
CYP3A4-inhibitor:	0.009
CYP3A4-substrate:	0.036

ADMET: Excretion

Clearance (CL):	6.617
Half-life (T1/2):	0.499

ADMET: Toxicity

hERG Blockers:	0.039
Human Hepatotoxicity (H-HT):	0.073
Drug-inuced Liver Injury (DILI):	0.008
AMES Toxicity:	0.262
Rat Oral Acute Toxicity:	0.185
Maximum Recommended Daily Dose:	0.014
Skin Sensitization:	0.527
Carcinogencity:	0.09
Eye Corrosion:	0.019
Eye Irritation:	0.088
Respiratory Toxicity:	0.377

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Data Type	Select
General Info & Identifiers & Properties
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Source Organisms
Biological Activities
Similar NPs/Drugs

Natural Product: NPC112890

Natural Product ID:	NPC112890
*Common Name:**	Lysine
IUPAC Name:	(2S)-2,6-diaminohexanoic acid
Synonyms:	Lysine
Standard InCHIKey:	KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N
Standard InCHI:	InChI=1S/C6H14N2O2/c7-4-2-1-3-5(8)6(9)10/h5H,1-4,7-8H2,(H,9,10)/t5-/m0/s1
SMILES:	NCCCC[C@@H](C(=O)O)N
Synthetic Gene Cluster:	n.a.
ChEMBL Identifier:	CHEMBL8085
PubChem CID:	5962 71774817
Chemical Classification:**	CHEMONTID:0000000 [Organic compounds] [CHEMONTID:0000264] Organic acids and derivatives [CHEMONTID:0000265] Carboxylic acids and derivatives [CHEMONTID:0000013] Amino acids, peptides, and analogues [CHEMONTID:0000347] Amino acids and derivatives [CHEMONTID:0000060] Alpha amino acids and derivatives [CHEMONTID:0002404] Alpha amino acids [CHEMONTID:0004146] L-alpha-amino acids

*Note: the InCHIKey will be temporarily assigned as the "Common Name" if no IUPAC name or alternative short name is available.
**Note: the Chemical Classification was calculated by NPClassifier Version 1.5. Reference: PMID:34662515.

Species Source

Organism ID	Organism Name	Taxonomy Level	Family	SuperKingdom	Isolation Part	Collection Location	Collection Time	Reference

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP source organism data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated them from below databases:
☉ UNPD: Universal Natural Products Database [PMID: 23638153].
☉ StreptomeDB: a database of streptomycetes natural products [PMID: 33051671].
☉ TM-MC: a database of medicinal materials and chemical compounds in Northeast Asian traditional medicine [PMID: 26156871].
☉ TCM@Taiwan: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 21253603].
☉ TCMID: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 29106634].
☉ TCMSP: The traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform [PMID: 24735618].
☉ HerDing: a herb recommendation system to treat diseases using genes and chemicals [PMID: 26980517].
☉ MetaboLights: a metabolomics database [PMID: 27010336].
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

NP Quantity Composition/Concentration

Organism ID	NP ID	Organism Material Preparation	Organism Part	NP Quantity (Standard)	NP Quantity (Minimum)	NP Quantity (Maximum)	Quantity Unit	Reference
NPO16501	NPC112890	Other	n.a.	36	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [All-Creatures]
NPO16501	NPC112890	Other	n.a.	60000	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO11120	NPC112890	Cooked	n.a.	89	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO163	NPC112890	Cooked	n.a.	63	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7576	NPC112890	Cooked	n.a.	86	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO25583	NPC112890	Cooked	n.a.	103	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO42011	NPC112890	Cooked	n.a.	30	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7576	NPC112890	Cooked	n.a.	141	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO15810	NPC112890	Cooked	n.a.	141	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO15810	NPC112890	Cooked	n.a.	153	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO15810	NPC112890	Cooked	n.a.	132	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO21174	NPC112890	Cooked	n.a.	209	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO21174	NPC112890	Cooked	n.a.	558	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO5105	NPC112890	Cooked	n.a.	20	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO26164	NPC112890	Cooked	n.a.	203	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12133	NPC112890	Cooked	n.a.	173	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7298	NPC112890	Cooked	n.a.	170	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO20898	NPC112890	Cooked	n.a.	110	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO22210	NPC112890	Cooked	n.a.	42	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO20898	NPC112890	Cooked	n.a.	75	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO29007	NPC112890	Cooked	n.a.	103	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO1802	NPC112890	Cooked	n.a.	66	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11043	NPC112890	Cooked	n.a.	252	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11043	NPC112890	Cooked	n.a.	314	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11043	NPC112890	Cooked	n.a.	302	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11043	NPC112890	Cooked	n.a.	497	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO16501	NPC112890	Cooked	n.a.	41	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO16501	NPC112890	Cooked	n.a.	42	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4359	NPC112890	Cooked	n.a.	120	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4359	NPC112890	Cooked	n.a.	128	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4359	NPC112890	Cooked	n.a.	183	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4359	NPC112890	Cooked	n.a.	150	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4359	NPC112890	Cooked	n.a.	188	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7539	NPC112890	Cooked	n.a.	33	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7635	NPC112890	Cooked	n.a.	739	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO14582	NPC112890	Cooked	n.a.	256	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO441	NPC112890	Cooked	n.a.	41	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO441	NPC112890	Cooked	n.a.	25	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO25206	NPC112890	Cooked	n.a.	33	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO25206	NPC112890	Cooked	n.a.	45	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO441	NPC112890	Cooked	n.a.	55	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO22287	NPC112890	Cooked	n.a.	23	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11120	NPC112890	Cooked	n.a.	61	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11120	NPC112890	Cooked	n.a.	218	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO11120	NPC112890	Cooked	n.a.	187	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO17336	NPC112890	Cooked	n.a.	9	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7298	NPC112890	Cooked	n.a.	113	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4934	NPC112890	Cooked	n.a.	106	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO7925	NPC112890	Cooked	n.a.	140	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4934	NPC112890	Cooked	n.a.	91	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO4934	NPC112890	Cooked	n.a.	72	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO15810	NPC112890	Cooked	n.a.	165	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO16501	NPC112890	Cooked	n.a.	34	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO42021	NPC112890	Cooked	n.a.	63	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO20898	NPC112890	Cooked	n.a.	123	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2448	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2244	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2328	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2368	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2351	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2246	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2441	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	1823	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2600	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2469	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2434	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2722	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2802	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2748	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2757	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2385	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2383	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2387	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2310	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2264	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2285	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2525	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2486	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2487	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2514	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2780	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2811	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	1957	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2334	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2446	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2471	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2820	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2245	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2296	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2625	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2740	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2760	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	1897	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	1954	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2327	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2291	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2304	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2058	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2072	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2485	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2333	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2836	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2318	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2766	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2262	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2906	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2373	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2874	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2346	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2796	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2301	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2952	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2390	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2461	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2415	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2508	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2429	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2528	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2283	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2326	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2339	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2313	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	3010	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	2963	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
NPO12323	NPC112890	Cooked	n.a.	3053	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [USDA]
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NPO42046	NPC112890	n.a.	n.a.	13	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO42046	NPC112890	n.a.	n.a.	19	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO42046	NPC112890	n.a.	n.a.	68	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO42046	NPC112890	n.a.	n.a.	75	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO5463	NPC112890	n.a.	n.a.	1700	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO6108	NPC112890	n.a.	n.a.	180	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO6108	NPC112890	n.a.	n.a.	270	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO6385	NPC112890	n.a.	n.a.	210	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO659	NPC112890	n.a.	n.a.	380	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO659	NPC112890	n.a.	n.a.	390	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO6997	NPC112890	n.a.	n.a.	130	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO6997	NPC112890	n.a.	n.a.	240	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7103	NPC112890	n.a.	n.a.	190	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7103	NPC112890	n.a.	n.a.	280	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7103	NPC112890	n.a.	n.a.	490	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7298.3	NPC112890	n.a.	n.a.	110	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7530	NPC112890	n.a.	n.a.	23	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7576.1	NPC112890	n.a.	n.a.	96	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7576.1	NPC112890	n.a.	n.a.	150	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7576.2	NPC112890	n.a.	n.a.	15	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7576.2	NPC112890	n.a.	n.a.	46	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7576.2	NPC112890	n.a.	n.a.	120	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7576.2	NPC112890	n.a.	n.a.	93	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO7635	NPC112890	n.a.	n.a.	2300	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
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NPO784	NPC112890	n.a.	n.a.	274	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO784	NPC112890	n.a.	n.a.	1844	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7925	NPC112890	n.a.	n.a.	67	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7925	NPC112890	n.a.	n.a.	75	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7925	NPC112890	n.a.	n.a.	80	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7925	NPC112890	n.a.	n.a.	100	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7960	NPC112890	n.a.	n.a.	1400	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8108	NPC112890	n.a.	n.a.	81	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8171	NPC112890	n.a.	n.a.	37	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8210	NPC112890	n.a.	n.a.	1684	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8255	NPC112890	n.a.	n.a.	243	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	29	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	240	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	280	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	290	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	310	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	330	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8541	NPC112890	n.a.	n.a.	490	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8896	NPC112890	n.a.	n.a.	810	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8896	NPC112890	n.a.	n.a.	860	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9299	NPC112890	n.a.	n.a.	350	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9498	NPC112890	n.a.	n.a.	952	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9503	NPC112890	n.a.	n.a.	76	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9503	NPC112890	n.a.	n.a.	77	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9632	NPC112890	n.a.	n.a.	37	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO13642	NPC112890	n.a.	Roots	91	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	24	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	29	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	33	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	35	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	49	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO163	NPC112890	n.a.	Roots	70	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO25583.1	NPC112890	n.a.	Roots	20	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO25583.1	NPC112890	n.a.	Roots	22	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO25583.1	NPC112890	n.a.	Roots	38	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO26721	NPC112890	n.a.	Roots	73	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7539.1	NPC112890	n.a.	Roots	35	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7539.1	NPC112890	n.a.	Roots	40	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7576.2	NPC112890	n.a.	Roots	57	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9865	NPC112890	n.a.	Roots	33	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO9865	NPC112890	n.a.	Roots	55	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO21556	NPC112890	n.a.	Sclerotia	0.074 ± 0.023	n.a.	n.a.	%	PMID[20527951]
NPO42047	NPC112890	n.a.	Seeds	2.99 ± 0.10	n.a.	n.a.	g/100g of protein	PMID[28255501]
NPO13281	NPC112890	n.a.	Seeds	0.93	n.a.	n.a.	%	DOI[10.5219/332]
NPO13281	NPC112890	n.a.	Seeds	0.97	n.a.	n.a.	%	PMID[31159190]
NPO18642	NPC112890	n.a.	Stalks	40	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO21582	NPC112890	n.a.	Tubers	44	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO2848	NPC112890	n.a.	Tubers	54	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	12	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	86	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	100	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	110	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	130	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	280	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	290	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	470	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC112890	n.a.	Tubers	630	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP quantitative records for specific NP domains (e.g., NPS from foods or herbs) from domain-specific databases. These databases include:
☉ DUKE: Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases.
☉ PHENOL EXPLORER: is the first comprehensive database on polyphenol content in foods [PMID: 24103452], its homepage can be accessed at here.
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

Biological Activity

Activity Type	# Activity
IC50	4
Kd	5
Ki	2
Others	25
Potency	1

Activity Type	# Activity
Individual Protein	9
NUCLEIC-ACID	2
Organism	6
Others	11
SINGLE PROTEIN	1
Tissue	1
Uncleic Acid	7

Target ID	Target Type	Target Name	Target Organism	Activity Type	Activity Relation	Value	Unit	Reference
NPT1557	Individual Protein	Glutathione reductase	Homo sapiens	IC50	=	61200.0	nM	PMID[520028]
NPT1557	Individual Protein	Glutathione reductase	Homo sapiens	Ki	=	54600.0	nM	PMID[520028]
NPT49	Individual Protein	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase	Homo sapiens	Potency	n.a.	141.3	nM	PMID[520033]
NPT1157	Individual Protein	L-type amino acid transporter 1	Homo sapiens	Inhibition	=	-2.1	%	PMID[520038]
NPT1157	Individual Protein	L-type amino acid transporter 1	Homo sapiens	Activity	=	33.0	%	PMID[520038]
NPT4435	Individual Protein	Dihydrodipicolinate synthase	Escherichia coli K-12	Inhibition	=	50.0	%	PMID[520040]
NPT4435	Individual Protein	Dihydrodipicolinate synthase	Escherichia coli K-12	Kis	=	0.2	mM	PMID[520040]
NPT4435	Individual Protein	Dihydrodipicolinate synthase	Escherichia coli K-12	IC50	=	180000.0	nM	PMID[520040]
NPT3993	Individual Protein	Dihydrodipicolinate synthase	Mycobacterium tuberculosis	IC50	=	250000000.0	nM	PMID[520040]
NPT2	Others	Unspecified	""	Log 1/T	=	1.07	n.a.	PMID[520019]
NPT35	Others	n.a.	""	LogP	=	-4.23	n.a.	PMID[520019]
NPT21975	NUCLEIC-ACID	Hairpin ribozyme RNA	n.a.	K obs	=	0.016	n.a.	PMID[520020]
NPT21975	NUCLEIC-ACID	Hairpin ribozyme RNA	n.a.	K obs	=	0.013	n.a.	PMID[520020]
NPT35	Others	n.a.	""	pKa	=	10.25	n.a.	PMID[520021]
NPT615	Tissue	Skin	Homo sapiens	log Kp	=	-6.86	n.a.	PMID[520022]
NPT2	Others	Unspecified	""	Ki	=	2800000.0	nM	PMID[520023]
NPT35	Others	n.a.	""	Activity	=	0.0	%	PMID[520024]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	Kd	=	360.0	nM	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	INH	=	2.3	Miller_unit	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	INH	=	200.0	Miller_unit	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	INH	=	184.0	Miller_unit	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	Kd	=	1700.0	nM	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	Kd	=	3000.0	nM	PMID[520026]
NPT317	Uncleic Acid	Nucleic Acid	""	Kd	=	2900.0	nM	PMID[520026]
NPT4315	Organism	Vicia faba	Vicia faba	Activity	=	104.0	%	PMID[520032]
NPT4315	Organism	Vicia faba	Vicia faba	Activity	=	99.6	%	PMID[520032]
NPT4315	Organism	Vicia faba	Vicia faba	Activity	=	97.0	%	PMID[520032]
NPT35	Others	n.a.	""	pKa	=	10.61	n.a.	PMID[520034]
NPT2	Others	Unspecified	""	Km	=	500.0	nM	PMID[520034]
NPT2	Others	Unspecified	""	Vmax	=	35.7	nmol/min/mg	PMID[520034]
NPT2	Others	Unspecified	""	Kd	=	360.0	nM	PMID[520035]
NPT35	Others	n.a.	""	Retention_time	=	2.01	min	PMID[520036]
NPT20555	ORGANISM	SARS-CoV-2	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2	Inhibition	=	-11.14	%	PMID[520039]
NPT2	Others	Unspecified	""	IC50	=	65000.0	nM	PMID[520040]
NPT20556	SINGLE PROTEIN	Replicase polyprotein 1ab	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2	Inhibition	=	9.479	%	PMID[520041]
NPT20555	ORGANISM	SARS-CoV-2	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2	Inhibition	=	0.01	%	PMID[520042]

☑ Note for Activity Records:
☉ The quantitative biological activities were primarily integrated from ChEMBL (Version-30) database and were also directly collected from PubMed literature. PubMed PMID was provided as the reference link for each activity record.

Chemically structural similarity: I. Similar Active Natural Products in NPASS

Top-200 similar NPs were calculated against the active-NP-set (includes 4,3285 NPs with experimentally-derived bioactivity available in NPASS)

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules. Tc lies between [0, 1] where '1' indicates the highest similarity. What is Tanimoto coefficient

● The left chart: Distribution of similarity level between NPC112890 and all remaining natural products in the NPASS database.
● The right table: Most similar natural products (Tc>=0.56 or Top200).

range	Tanimoto Coefficient
0-0.1	311
0.1-0.2	24870
0.2-0.3	14445
0.3-0.4	2154
0.4-0.5	569
0.5-0.6	174
0.6-0.7	107
0.7-0.8	51
0.8-0.85	3
0.85-0.9	10
0.9-0.95	0
0.95-1	3

Similarity Score	Similarity Level	Natural Product ID
1.0	High Similarity	NPC316231
1.0	High Similarity	NPC324825
0.8936	High Similarity	NPC140872
0.8936	High Similarity	NPC93081
0.8889	High Similarity	NPC323974
0.88	High Similarity	NPC183845
0.88	High Similarity	NPC279661
0.8696	High Similarity	NPC118459
0.8696	High Similarity	NPC327698
0.8654	High Similarity	NPC278209
0.8491	Intermediate Similarity	NPC189301
0.8491	Intermediate Similarity	NPC176164
0.8333	Intermediate Similarity	NPC320598
0.8333	Intermediate Similarity	NPC254541
0.8182	Intermediate Similarity	NPC68974
0.8	Intermediate Similarity	NPC268927
0.8	Intermediate Similarity	NPC84636
0.8	Intermediate Similarity	NPC245027
0.8	Intermediate Similarity	NPC64250
0.8	Intermediate Similarity	NPC62045
0.8	Intermediate Similarity	NPC226027
0.8	Intermediate Similarity	NPC174246
0.8	Intermediate Similarity	NPC162620
0.8	Intermediate Similarity	NPC43204
0.8	Intermediate Similarity	NPC276928
0.7917	Intermediate Similarity	NPC329263
0.7885	Intermediate Similarity	NPC190184
0.7885	Intermediate Similarity	NPC197087
0.7872	Intermediate Similarity	NPC276294
0.7843	Intermediate Similarity	NPC50457
0.7843	Intermediate Similarity	NPC273330
0.7843	Intermediate Similarity	NPC137958
0.7826	Intermediate Similarity	NPC326992
0.7826	Intermediate Similarity	NPC121517
0.7826	Intermediate Similarity	NPC168375
0.7692	Intermediate Similarity	NPC155512
0.7627	Intermediate Similarity	NPC278881
0.75	Intermediate Similarity	NPC291186
0.75	Intermediate Similarity	NPC167986
0.7455	Intermediate Similarity	NPC325985
0.7455	Intermediate Similarity	NPC38463
0.7347	Intermediate Similarity	NPC126925
0.7347	Intermediate Similarity	NPC132307
0.7347	Intermediate Similarity	NPC325097
0.7273	Intermediate Similarity	NPC2801
0.7255	Intermediate Similarity	NPC136159
0.7255	Intermediate Similarity	NPC101249
0.7193	Intermediate Similarity	NPC302003
0.7193	Intermediate Similarity	NPC11433
0.7193	Intermediate Similarity	NPC245346
0.7119	Intermediate Similarity	NPC118429
0.7115	Intermediate Similarity	NPC153370
0.7097	Intermediate Similarity	NPC188231
0.7097	Intermediate Similarity	NPC222327
0.7097	Intermediate Similarity	NPC314221
0.7097	Intermediate Similarity	NPC60424
0.7083	Intermediate Similarity	NPC237525
0.7083	Intermediate Similarity	NPC66043
0.7083	Intermediate Similarity	NPC53449
0.7083	Intermediate Similarity	NPC326212
0.7069	Intermediate Similarity	NPC317143
0.7069	Intermediate Similarity	NPC327748
0.7069	Intermediate Similarity	NPC321468
0.7069	Intermediate Similarity	NPC321536
0.7069	Intermediate Similarity	NPC316826
0.7059	Intermediate Similarity	NPC136476
0.7059	Intermediate Similarity	NPC49952
0.7021	Intermediate Similarity	NPC18188
0.7018	Intermediate Similarity	NPC318260
0.7018	Intermediate Similarity	NPC317147
0.6984	Remote Similarity	NPC107224
0.6964	Remote Similarity	NPC322573
0.6957	Remote Similarity	NPC272614
0.6957	Remote Similarity	NPC21290
0.6957	Remote Similarity	NPC116709
0.6949	Remote Similarity	NPC329564
0.6949	Remote Similarity	NPC327170
0.6949	Remote Similarity	NPC143722
0.6897	Remote Similarity	NPC319279
0.6897	Remote Similarity	NPC190385
0.6885	Remote Similarity	NPC103130
0.6885	Remote Similarity	NPC226453
0.6875	Remote Similarity	NPC15864
0.6863	Remote Similarity	NPC208793
0.6863	Remote Similarity	NPC285322
0.6852	Remote Similarity	NPC125736
0.6818	Remote Similarity	NPC315897
0.6809	Remote Similarity	NPC63621
0.6731	Remote Similarity	NPC297220
0.6731	Remote Similarity	NPC213876
0.6731	Remote Similarity	NPC309658
0.6731	Remote Similarity	NPC185755
0.6667	Remote Similarity	NPC270805
0.6667	Remote Similarity	NPC170739
0.6667	Remote Similarity	NPC327985
0.6667	Remote Similarity	NPC193989
0.6667	Remote Similarity	NPC152451
0.6667	Remote Similarity	NPC328378
0.6667	Remote Similarity	NPC198301
0.6667	Remote Similarity	NPC93888
0.6613	Remote Similarity	NPC315744
0.6613	Remote Similarity	NPC289691
0.6604	Remote Similarity	NPC181588
0.6567	Remote Similarity	NPC185084
0.6545	Remote Similarity	NPC315977
0.6508	Remote Similarity	NPC174304
0.6508	Remote Similarity	NPC325597
0.6491	Remote Similarity	NPC60672
0.6491	Remote Similarity	NPC316889
0.6491	Remote Similarity	NPC321118
0.6491	Remote Similarity	NPC322091
0.6429	Remote Similarity	NPC200550
0.6429	Remote Similarity	NPC155156
0.6429	Remote Similarity	NPC322946
0.6406	Remote Similarity	NPC287693
0.6406	Remote Similarity	NPC325534
0.6379	Remote Similarity	NPC327831
0.6364	Remote Similarity	NPC133183
0.6364	Remote Similarity	NPC322274
0.6349	Remote Similarity	NPC106216
0.6349	Remote Similarity	NPC88898
0.6316	Remote Similarity	NPC263065
0.6316	Remote Similarity	NPC317815
0.6316	Remote Similarity	NPC189178
0.6308	Remote Similarity	NPC118524
0.6308	Remote Similarity	NPC196359
0.6308	Remote Similarity	NPC78312
0.6308	Remote Similarity	NPC135539
0.6308	Remote Similarity	NPC221764
0.6304	Remote Similarity	NPC328710
0.6304	Remote Similarity	NPC18224
0.6304	Remote Similarity	NPC175342
0.6296	Remote Similarity	NPC204364
0.629	Remote Similarity	NPC302188
0.6275	Remote Similarity	NPC226265
0.6275	Remote Similarity	NPC326808
0.6275	Remote Similarity	NPC219143
0.6275	Remote Similarity	NPC254482
0.6275	Remote Similarity	NPC110533
0.6275	Remote Similarity	NPC317691
0.625	Remote Similarity	NPC472609
0.625	Remote Similarity	NPC114990
0.625	Remote Similarity	NPC50047
0.625	Remote Similarity	NPC9294
0.6212	Remote Similarity	NPC319046
0.6182	Remote Similarity	NPC327542
0.6176	Remote Similarity	NPC328457
0.614	Remote Similarity	NPC29950
0.614	Remote Similarity	NPC19576
0.6129	Remote Similarity	NPC177191
0.6119	Remote Similarity	NPC126779
0.6111	Remote Similarity	NPC198196
0.6102	Remote Similarity	NPC102815
0.6094	Remote Similarity	NPC57420
0.6042	Remote Similarity	NPC317203
0.6034	Remote Similarity	NPC329495
0.6034	Remote Similarity	NPC474322
0.6	Remote Similarity	NPC316168
0.6	Remote Similarity	NPC320221
0.5965	Remote Similarity	NPC319175
0.5965	Remote Similarity	NPC327239
0.5957	Remote Similarity	NPC114517
0.5918	Remote Similarity	NPC134782
0.5918	Remote Similarity	NPC155263
0.5915	Remote Similarity	NPC327272
0.5909	Remote Similarity	NPC470108
0.5893	Remote Similarity	NPC96966
0.5893	Remote Similarity	NPC29222
0.5893	Remote Similarity	NPC121062
0.5873	Remote Similarity	NPC321419
0.5867	Remote Similarity	NPC219340
0.5862	Remote Similarity	NPC202525
0.5857	Remote Similarity	NPC55274
0.5833	Remote Similarity	NPC10915
0.5821	Remote Similarity	NPC470109
0.5818	Remote Similarity	NPC228932
0.58	Remote Similarity	NPC252843
0.58	Remote Similarity	NPC109026
0.58	Remote Similarity	NPC69179
0.5789	Remote Similarity	NPC286989
0.5789	Remote Similarity	NPC17244
0.5781	Remote Similarity	NPC322206
0.5778	Remote Similarity	NPC126681
0.5763	Remote Similarity	NPC123814
0.5763	Remote Similarity	NPC8488
0.5763	Remote Similarity	NPC333075
0.5763	Remote Similarity	NPC245768
0.5763	Remote Similarity	NPC274499
0.5735	Remote Similarity	NPC470110
0.5714	Remote Similarity	NPC306973
0.5714	Remote Similarity	NPC118187
0.5692	Remote Similarity	NPC327252
0.5686	Remote Similarity	NPC73245
0.5686	Remote Similarity	NPC268826
0.5667	Remote Similarity	NPC145235
0.5652	Remote Similarity	NPC174368
0.5636	Remote Similarity	NPC191136
0.5614	Remote Similarity	NPC227850
0.5614	Remote Similarity	NPC318523
0.5614	Remote Similarity	NPC193872

Chemically structural similarity: II. Similar Clinical/Approved Drugs

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules.

● The left chart: Distribution of similarity level between NPC112890 and all drugs/candidates.
● The right table: Most similar clinical/approved drugs (Tc>=0.56 or Top200).

range	Tanimoto Coefficient
0-0.1	189
0.1-0.2	5199
0.2-0.3	2758
0.3-0.4	637
0.4-0.5	225
0.5-0.6	58
0.6-0.7	56
0.7-0.8	24
0.8-0.85	0
0.85-0.9	2
0.9-0.95	0
0.95-1	2

Similarity Score	Similarity Level	Drug ID	Developmental Stage
1.0	High Similarity	NPD9044	Approved
0.9565	High Similarity	NPD9016	Clinical (unspecified phase)
0.8936	High Similarity	NPD8809	Approved
0.8936	High Similarity	NPD8808	Approved
0.8889	High Similarity	NPD9019	Approved
0.8	Intermediate Similarity	NPD9018	Approved
0.8	Intermediate Similarity	NPD9017	Approved
0.7885	Intermediate Similarity	NPD8785	Approved
0.7843	Intermediate Similarity	NPD8871	Approved
0.7843	Intermediate Similarity	NPD8872	Phase 3
0.7547	Intermediate Similarity	NPD8851	Phase 1
0.75	Intermediate Similarity	NPD8804	Approved
0.75	Intermediate Similarity	NPD8805	Approved
0.7455	Intermediate Similarity	NPD8980	Approved
0.7455	Intermediate Similarity	NPD8981	Clinical (unspecified phase)
0.7455	Intermediate Similarity	NPD8979	Approved
0.7347	Intermediate Similarity	NPD8798	Approved
0.7258	Intermediate Similarity	NPD9451	Clinical (unspecified phase)
0.7255	Intermediate Similarity	NPD8866	Approved
0.7255	Intermediate Similarity	NPD8867	Approved
0.7193	Intermediate Similarity	NPD8865	Approved
0.7193	Intermediate Similarity	NPD9433	Approved
0.7143	Intermediate Similarity	NPD9454	Approved
0.7119	Intermediate Similarity	NPD9014	Approved
0.7115	Intermediate Similarity	NPD8614	Approved
0.7097	Intermediate Similarity	NPD9421	Phase 1
0.7021	Intermediate Similarity	NPD8623	Phase 1
0.7	Intermediate Similarity	NPD9676	Phase 3
0.6957	Remote Similarity	NPD8210	Phase 3
0.6957	Remote Similarity	NPD8211	Approved
0.6923	Remote Similarity	NPD8850	Approved
0.6897	Remote Similarity	NPD9023	Clinical (unspecified phase)
0.6897	Remote Similarity	NPD9438	Approved
0.6897	Remote Similarity	NPD9439	Approved
0.6885	Remote Similarity	NPD9045	Approved
0.6885	Remote Similarity	NPD9048	Approved
0.6885	Remote Similarity	NPD9047	Approved
0.6885	Remote Similarity	NPD9046	Phase 3
0.6863	Remote Similarity	NPD8610	Approved
0.6818	Remote Similarity	NPD6944	Clinical (unspecified phase)
0.6818	Remote Similarity	NPD1825	Clinical (unspecified phase)
0.6731	Remote Similarity	NPD8801	Approved
0.6731	Remote Similarity	NPD8982	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD8971	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD8624	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD9201	Clinical (unspecified phase)
0.6667	Remote Similarity	NPD8803	Clinical (unspecified phase)
0.6667	Remote Similarity	NPD8946	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD9021	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD8802	Approved
0.6667	Remote Similarity	NPD8947	Approved
0.6604	Remote Similarity	NPD8810	Clinical (unspecified phase)
0.6562	Remote Similarity	NPD9232	Phase 2
0.6562	Remote Similarity	NPD9233	Phase 3
0.6562	Remote Similarity	NPD9231	Phase 3
0.6508	Remote Similarity	NPD348	Approved
0.6471	Remote Similarity	NPD9217	Clinical (unspecified phase)
0.6429	Remote Similarity	NPD9441	Phase 2
0.6406	Remote Similarity	NPD8952	Approved
0.6377	Remote Similarity	NPD632	Discontinued
0.6316	Remote Similarity	NPD9205	Approved
0.6316	Remote Similarity	NPD9204	Approved
0.6316	Remote Similarity	NPD8849	Clinical (unspecified phase)
0.6308	Remote Similarity	NPD886	Clinical (unspecified phase)
0.6308	Remote Similarity	NPD1429	Clinical (unspecified phase)
0.6308	Remote Similarity	NPD8868	Approved
0.6296	Remote Similarity	NPD8972	Approved
0.6296	Remote Similarity	NPD8973	Approved
0.629	Remote Similarity	NPD9656	Approved
0.6275	Remote Similarity	NPD8215	Approved
0.6275	Remote Similarity	NPD8609	Approved
0.6275	Remote Similarity	NPD8214	Approved
0.6275	Remote Similarity	NPD8217	Clinical (unspecified phase)
0.6275	Remote Similarity	NPD8216	Approved
0.6212	Remote Similarity	NPD337	Discontinued
0.6212	Remote Similarity	NPD4241	Registered
0.6207	Remote Similarity	NPD631	Approved
0.6207	Remote Similarity	NPD630	Approved
0.6182	Remote Similarity	NPD8873	Approved
0.6176	Remote Similarity	NPD2262	Clinical (unspecified phase)
0.614	Remote Similarity	NPD8846	Approved
0.614	Remote Similarity	NPD8847	Approved
0.614	Remote Similarity	NPD61	Approved
0.6119	Remote Similarity	NPD4242	Approved
0.6111	Remote Similarity	NPD9020	Approved
0.6087	Remote Similarity	NPD1147	Phase 2
0.6061	Remote Similarity	NPD8842	Clinical (unspecified phase)
0.6027	Remote Similarity	NPD617	Approved
0.6	Remote Similarity	NPD366	Approved
0.6	Remote Similarity	NPD8209	Phase 2
0.6	Remote Similarity	NPD8208	Clinical (unspecified phase)
0.5965	Remote Similarity	NPD9025	Approved
0.5821	Remote Similarity	NPD375	Phase 2
0.5797	Remote Similarity	NPD2220	Clinical (unspecified phase)
0.5789	Remote Similarity	NPD9230	Discontinued
0.5781	Remote Similarity	NPD574	Approved
0.5778	Remote Similarity	NPD7371	Approved
0.5775	Remote Similarity	NPD9109	Discontinued
0.5763	Remote Similarity	NPD3215	Phase 1
0.5741	Remote Similarity	NPD9062	Phase 2
0.5692	Remote Similarity	NPD575	Clinical (unspecified phase)
0.569	Remote Similarity	NPD3214	Discontinued

Bioactivity similarity: Similar Natural Products in NPASS

Bioactivity similarity was calculated based on bioactivity descriptors of compounds. The bioactivity descriptors were calculated by a recently developed AI algorithm Chemical Checker (CC) [Nature Biotechnology, 38:1087–1096, 2020; Nature Communications, 12:3932, 2021], which evaluated bioactivity similarities at five levels:
☉ A: chemistry similarity;
☉ B: biological targets similarity;
☉ C: networks similarity;
☉ D: cell-based bioactivity similarity;
☉ E: similarity based on clinical data.

Those 5 categories of CC bioactivity descriptors were calculated and then subjected to manifold projection using UMAP algorithm, to project all NPs on a 2-Dimensional space. The current NP was highlighted with a small circle in the 2-D map. Below figures: left-to-right, A-to-E.

A: chemistry similarity

B: biological targets similarity

C: networks similarity

D: cell-based bioactivity similarity

E: similarity based on clinical data