NPASS species

Organism Name: Citrus paradisi

Organism ID:	NPO5386
Organism Name:	Citrus paradisi
Native / Engineered Organism:	Native Organism
Matched Taxonomy Level:	Species
Organism External ID:	NCBI_Taxonomy_ID[ 37656]
Organism Synonyms:
Genus:	Citrus
Family:	Rutaceae
Kingdom:	Viridiplantae
SuperKingdom:	Eukaryota

Individual Natural Products

Natural Product ID	Prefer Name (or InChiKey)	IUPAC Name	Number of Targets	Number of Activity Records
NPC36911	OKILVWSNJYSCMZ-ZDLGJSOLSA-N	n.a.	0	0
NPC284311	VLEOOTHUCLNEHY-HCCCIJMNSA-N	n.a.	0	0
NPC138572	HXTFHSYLYXVTHC-VVPRDUQFSA-N	n.a.	0	0
NPC21380	RFTIRMPAYWBDKJ-GSTFJIRZSA-N	n.a.	0	0
NPC110008	GSVYFPMXLIFUDJ-ONEGZZNKSA-N	n.a.	0	0
NPC231507	NLDIZAGVYXETLE-NRFANRHFSA-N	n.a.	0	0
NPC13991	Alpha-Pinene	4,6,6-trimethylbicyclo[3.1.1]hept-3-ene	16	59
NPC259659	BRHQPRAQLMOAKC-MRNPFCMQSA-N	n.a.	0	0
NPC285173	IISIYJPTBDSIFM-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC237155	Nomilin	n.a.	7	12
NPC70261	DSWGTWGCIOOKRQ-ULBDXNRZSA-N	n.a.	0	0
NPC255221	SFUVCMKSYKHYLD-FNORWQNLSA-N	n.a.	0	0
NPC221491	BKXIGVQZLPZYLM-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC123965	Squalene	(6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene	9	17
NPC44830	12-Phenyldodecanoic Acid	12-phenyldodecanoic acid	14	16
NPC302556	ARGKVCXINMKCAZ-VJROLDEYSA-N	n.a.	0	0
NPC73840	JVPLVXRNWLOHML-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC218109	ZMDOPLQSOGZPJN-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC287397	(E)-2-Undecenal	(E)-undec-2-enal	16	17
NPC198658	IHPKGUQCSIINRJ-NTMALXAHSA-N	n.a.	0	0
NPC76145	Limonene	(4R)-1-methyl-4-prop-1-en-2-ylcyclohexene	43	225
NPC190771	WTEVQBCEXWBHNA-YFHOEESVSA-N	n.a.	0	0
NPC157192	KZJWDPNRJALLNS-FBZNIEFRSA-N	n.a.	0	0
NPC258314	VWDLOXMZIGUBKM-LQTCTXRMSA-N	n.a.	0	0
NPC216630	Palmitic Acid	hexadecanoic acid	59	236
NPC79011	ONICYSBMOZSVKS-DBZSEJJRSA-N	n.a.	0	0
NPC177365	JHBBZIAPXDEPET-OVRPQICKSA-N	n.a.	0	0
NPC84807	NUJGJRNETVAIRJ-COJKEBBMSA-N	n.a.	0	0
NPC26600	Neryl Acetate	[(2Z)-3,7-dimethylocta-2,6-dienyl] acetate	5	41
NPC7089	AUQIXRHHSITZFM-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC182840	Nerol	(2Z)-3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-ol	13	71
NPC236602	BAVONGHXFVOKBV-NXEZZACHSA-N	n.a.	0	0
NPC22098	Citronellal	(3R)-3,7-dimethyloct-6-enal	10	69
NPC211442	WOYWLLHHWAMFCB-JTQLQIEISA-N	n.a.	0	0
NPC175122	CCEFMUBVSUDRLG-BBBLOLIVSA-N	n.a.	0	0
NPC178158	OKILVWSNJYSCMZ-IGIKESJTSA-N	n.a.	0	0
NPC130760	QUQPHWDTPGMPEX-UNZJSITISA-N	n.a.	0	0
NPC96388	BEEKFGLUGMQFSX-RCCFBDPRSA-N	n.a.	0	0
NPC122962	3-Octanol	octan-3-ol	7	7
NPC22140	NPJICTMALKLTFW-VPFCYKORSA-N	n.a.	1	2
NPC135353	HFJRKMMYBMWEAD-UHFFFAOYSA-N	n.a.	1	7
NPC37466	NNPKCOMNQNWPNS-GDWUOILNSA-N	n.a.	0	0
NPC41180	(E)-Linalool Oxide	2-[(2S,5S)-5-ethenyl-5-methyloxolan-2-yl]propan-2-ol	2	7
NPC53403	CCEFMUBVSUDRLG-KXUCPTDWSA-N	n.a.	0	0
NPC15912	Linalyl Acetate	3,7-dimethylocta-1,6-dien-3-yl acetate	11	54
NPC158088	Stigmasterol Glucoside	(2R,3R,4S,5S,6R)-2-[[(3S,8S,9S,10R,13R,14S,17R)-17-[(E,2R,5S)-5-ethyl-6-methylhept-3-en-2-yl]-10,13-dimethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol	9	9
NPC254509	BDHQMRXFDYJGII-UEBIAWITSA-N	n.a.	4	9
NPC230786	BEAROWPOUPFNRD-HEZIXOHUSA-N	n.a.	0	0
NPC289388	Citronellyl Acetate	3,7-dimethyloct-6-enyl acetate	7	15
NPC49151	Nonanal	nonanal	3	17
NPC315877	DNYABHDQAOSFRC-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC17695	JHBBZIAPXDEPET-OWRNNQENSA-N	n.a.	0	0
NPC86058	PBJHEIRFTYGACF-MDNUFGMLSA-N	n.a.	0	0
NPC243728	Daucosterol	(2R,3R,4S,5S,6R)-2-[[(3S,8S,9S,10R,13R,14S,17R)-17-[(2R,5R)-5-ethyl-6-methylheptan-2-yl]-10,13-dimethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol	37	69
NPC289668	HCXVJBMSMIARIN-KEJCWXRGSA-N	n.a.	0	0
NPC302439	FMIPNAUMSPFTHK-UHNVWZDZSA-N	n.a.	0	0
NPC88566	P-Cymene	1-methyl-4-propan-2-ylbenzene	12	33
NPC242580	Vitamin E	(2R)-2,5,7,8-tetramethyl-2-[(4R,8R)-4,8,12-trimethyltridecyl]-3,4-dihydrochromen-6-ol	57	425
NPC97515	KBXLOAWJUIAVPA-CEWLAPEOSA-N	n.a.	0	0
NPC294200	YTQLYPLDMHKTML-JHZVCAIQSA-N	n.a.	0	0
NPC4817	WTOYNNBCKUYIKC-MQYJIDSJSA-N	n.a.	0	0
NPC182385	HPQHLPLKDXMGOP-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC13789	(-)-Caryophyllene Oxide	n.a.	7	11
NPC210831	VLXDPFLIRFYIME-PLWLXLEKSA-N	n.a.	0	0
NPC304760	1-Phenylethyl Acetate	1-phenylethyl acetate	1	3
NPC141078	DFPMSGMNTNDNHN-BRZCDTLOSA-N	n.a.	0	0
NPC89180	CWLQUGTUXBXTLF-RXMQYKEDSA-N	n.a.	0	0
NPC18205	Citral	(2E)-3,7-dimethylocta-2,6-dienal	12	26
NPC489907	Cyanidin 3-(6''-acetyl-galactoside)	n.a.	0	0
NPC55412	Retinol	(2E,4E,6E,8E)-3,7-dimethyl-9-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)nona-2,4,6,8-tetraen-1-ol	108	1655
NPC17810	Beta Carotene	1,3,3-trimethyl-2-[(1E,3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-1,3,5,7,9,11,13,15,17-nonaenyl]cyclohexene	20	189
NPC189436	Thiamine Hydrochloride	[5-[[5-(2-hydroxyethyl)-4-methyl-1,3-thiazol-3-ium-3-yl]methyl]-2-methylpyrimidin-4-yl]azanium;dichloride	11	16
NPC94167	Riboflavin	7,8-dimethyl-10-[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]benzo[g]pteridine-2,4-dione	45	211
NPC167400	Niacin	pyridine-3-carboxylic acid	65	1934
NPC269919	Pyridoxine	4,5-bis(hydroxymethyl)-2-methylpyridin-3-ol	16	45
NPC328447	Pantothenic Acid, Racemic	3-[(2,4-dihydroxy-3,3-dimethylbutanoyl)amino]propanoic acid	1	2
NPC199072	Biotin	5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid	19	46
NPC147983	Folic Acid	(2S)-2-[[4-[(2-amino-4-oxo-1H-pteridin-6-yl)methylamino]benzoyl]amino]pentanedioic acid	57	137
NPC187770	Ascorbate	(2R)-2-[(1S)-1,2-dihydroxyethyl]-3,4-dihydroxy-2H-furan-5-one	62	1115
NPC490424	D-Fructose	n.a.	0	0
NPC490427	D-Mannose	n.a.	0	0
NPC269980	CZMRCDWAGMRECN-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC130683	Sucrose	(2R,3R,4S,5S,6R)-2-[(2S,3S,4S,5R)-3,4-dihydroxy-2,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol	28	62
NPC424	Elaidic Acid	(E)-octadec-9-enoic acid	12	27
NPC85813	Linoleic Acid	(9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoic acid	60	235
NPC294548	Linolenic Acid	(9Z,12Z,15Z)-octadeca-9,12,15-trienoic acid	78	247
NPC174246	Isoleucine	(2S,3S)-2-amino-3-methylpentanoic acid	3	7
NPC62045	2-Azaniumyl-4-Methylpentanoate	2-azaniumyl-4-methylpentanoate	57	57
NPC112890	Lysine	(2S)-2,6-diaminohexanoic acid	13	37
NPC152451	Methionine	(2S)-2-amino-4-methylsulfanylbutanoic acid	17	59
NPC185755	Cystine	(2R)-2-amino-3-[[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]disulfanyl]propanoic acid	9	24
NPC281686	Dl-3-(4-Hydroxyphenyl)Alanine	2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoic acid	3	17
NPC93888	Threonine	(2S,3R)-2-amino-3-hydroxybutanoic acid	5	19
NPC203468	Tryptophan	(2S)-2-amino-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid	78	271
NPC226453	Arginine	(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneazaniumyl)pentanoate	43	119
NPC237812	Histidine	(2S)-2-amino-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoic acid	33	118
NPC272614	L-Alanine	(2S)-2-aminopropanoic acid	14	22
NPC208793	Aspartic Acid	(2S)-2-aminobutanedioic acid	42	70
NPC137958	L-Glutamate	(2S)-2-azaniumyl-5-hydroxy-5-oxopentanoate	87	484
NPC126681	Glycine	2-aminoacetic acid	22	262
NPC11433	L-Proline	(2S)-pyrrolidine-2-carboxylic acid	15	24
NPC317120	MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC229851	RMCRQBAILCLJGU-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC43587	Eriocitrin	(2S)-2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5-hydroxy-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-[[(2R,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]oxy-2,3-dihydrochromen-4-one	5	5
NPC79056	Hesperidin	(2S)-5-hydroxy-2-(3-hydroxy-4-methoxyphenyl)-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-[[(2R,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]oxy-2,3-dihydrochromen-4-one	42	68
NPC32441	Naringenin	(2S)-5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	142	327
NPC142860	Naringin	(2S)-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	38	69
NPC490458	Naringenin 4'-glucoside	n.a.	0	0
NPC490159	Naringin 6''-malonate	n.a.	0	0
NPC490162	Narirutin	n.a.	0	0
NPC490163	Narirutin 4'-glucoside	n.a.	0	0
NPC190270	OBKKEZLIABHSGY-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC177771	ARGKVCXINMKCAZ-UHFFFAOYSA-N	n.a.	7	7
NPC490311	Poncirin	n.a.	0	0
NPC131482	RPMNUQRUHXIGHK-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC490157	Rhoifolin 4-glucoside	n.a.	0	0
NPC20791	Quercetin	2-(3,4-dihydroxyphenyl)-3,5,7-trihydroxychromen-4-one	553	2064
NPC74539	Bergapten	4-methoxyfuro[3,2-g]chromen-7-one	111	201
NPC490449	Phlorin	n.a.	0	0
NPC302950	Hesperetin	(2S)-5,7-dihydroxy-2-(3-hydroxy-4-methoxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	80	174
NPC116775	Kaempferol	3,5,7-trihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)chromen-4-one	208	612
NPC29883	Paraben	4-oxoniobenzoate	78	176
NPC225710	Gallic Acid	3,4,5-trihydroxybenzoic acid	146	467
NPC111888	Vanillic Acid	4-hydroxy-3-methoxybenzoic acid	45	104
NPC294902	Caffeic Acid	(E)-3-(3,4-dihydroxyphenyl)prop-2-enoic acid	219	596
NPC81010	Coumaric Acid	(E)-3-(4-hydroxyphenyl)prop-2-enoic acid	85	213
NPC265305	cis-Ferulic acid	n.a.	0	0
NPC300326	Sinapinate	(E)-3-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)prop-2-enoic acid	25	59
NPC279865	ANVAOWXLWRTKGA-NTXLUARGSA-N	n.a.	0	0
NPC2660	DMASLKHVQRHNES-QQGJMDNJSA-N	n.a.	0	0
NPC150950	Thiamine	2-[3-[(4-amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-1,3-thiazol-3-ium-5-yl]ethanol	15	43
NPC136014	Choline	2-hydroxyethyl(trimethyl)azanium	32	60
NPC39426	Genistein	5,7-dihydroxy-3-(4-hydroxyphenyl)chromen-4-one	378	1494
NPC201284	Isoflavone	3-phenylchromen-4-one	2	2
NPC279121	Luteolin	2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxychromen-4-one	269	872
NPC169749	Myricetin	3,5,7-trihydroxy-2-(3,4,5-trihydroxyphenyl)chromen-4-one	266	731
NPC164487	DMASLKHVQRHNES-FKKUPVFPSA-N	n.a.	0	0
NPC1682	2-Methyl-3-[(E)-3,7,11,15-Tetramethylhexadec-2-Enyl]Naphthalene-1,4-Dione	2-methyl-3-[(E)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-enyl]naphthalene-1,4-dione	16	20
NPC201844	Dodecanoate	dodecanoic acid	50	131
NPC213876	2-Azaniumyl-3-[(2-Azaniumyl-2-Carboxylatoethyl)Disulfanyl]Propanoate	2-azaniumyl-3-[(2-azaniumyl-2-carboxylatoethyl)disulfanyl]propanoate	5	9
NPC219143	Serine	(2S)-2-azaniumyl-3-hydroxypropanoate	17	26
NPC226027	2-Azaniumyl-3-Methylpentanoate	2-azaniumyl-3-methylpentanoate	4	13
NPC290319	OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N	n.a.	0	0
NPC313955	HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N	n.a.	0	0
NPC491218	Biotin	n.a.	0	0
NPC491384	Sugars	n.a.	0	0
NPC59650	Glycinebetaine	2-(trimethylazaniumyl)acetate	23	56
NPC60151	GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N	n.a.	7	24
NPC99088	Lycopene	(6E,8E,10E,12E,14E,16E,18E,20E,22E,24E,26E)-2,6,10,14,19,23,27,31-octamethyldotriaconta-2,6,8,10,12,14,16,18,20,22,24,26,30-tridecaene	14	43
NPC100551	Salicylic Acid	2-hydroxybenzoic acid	110	560
NPC105095	Neohesperidin	(2S)-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2-(3-hydroxy-4-methoxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	7	7
NPC156654	Protocatechuic Acid	3,4-dihydroxybenzoic acid	81	181
NPC228346	4,4'-((1S,3Ar,4S,6Ar)-Hexahydrofuro[3,4-C]Furan-1,4-Diyl)Bis(2-Methoxyphenol)	4-[(3S,3aR,6S,6aR)-6-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrofuro[3,4-c]furan-3-yl]-2-methoxyphenol	8	10
NPC230573	WXTPOHDTGNYFSB-RMPHRYRLSA-N	n.a.	0	0
NPC257582	Lariciresinol	4-[[(3R,4R,5S)-5-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)-4-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]methyl]-2-methoxyphenol	18	36
NPC271270	Narirutin	(2S)-5-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-[[(2R,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]oxy-2,3-dihydrochromen-4-one	6	8
NPC291124	OBKKEZLIABHSGY-DOYQYKRZSA-N	n.a.	0	0
NPC491318	Total Anthocyanins	n.a.	0	0
NPC491367	Total Polyphenols	n.a.	0	0
NPC65003	Rhoifolin	7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)chromen-4-one	63	67
NPC68779	Matairesinol	(3R,4R)-3,4-bis[(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)methyl]oxolan-2-one	19	32
NPC70206	RMCRQBAILCLJGU-HIBKWJPLSA-N	n.a.	0	0
NPC70744	Ferulic Acid	(E)-3-(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)prop-2-enoic acid	146	590
NPC79943	5,7-Dihydroxy-2-(4-Hydroxyphenyl)-2,3-Dihydrochromen-4-One	5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	35	59
NPC85488	(+)-Secoisolariciresinol	(2R,3R)-2,3-bis[(4-hydroxy-3-methoxyphenyl)methyl]butane-1,4-diol	32	64
NPC97285	Poncirin	(2S)-7-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3R,4R,5R,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2-(4-methoxyphenyl)-2,3-dihydrochromen-4-one	1	1

NPs produced by Co-culture Organisms (for Co-culture organisms, the full organism list can be found HERE)

Organism Name	Producer Organism	Inducer Organism	NP ID	NP Name	Effect of Co-culture	Reference

NPs produced by Engineered Organisms (for Engineered organisms, the full organism list can be found HERE)

Organism Name	Parent Organism Name	Engineered Gene in Organism	Purpose of Engineering	Engineering Category	Engineering Description	NP ID	NP Name	NP Yeild of Parent Organism	NP Yeild of Engineered Organism	Yeild Change	Reference

The Quantitative Compositions of NPs in Organism

Organism ID	NP ID	Organism Material Preparation	Organism Part	NP Quantity (Standard)	NP Quantity (Minimum)	NP Quantity (Maximum)	Quantity Unit	Reference
NPO5386	NPC55412	Beverage (juice)	n.a.	10	n.a.	n.a.	IU	Database [USDA]
NPO5386	NPC55412	Beverage (juice)	n.a.	440	n.a.	n.a.	IU	Database [USDA]
NPO5386	NPC39426	n.a.	n.a.	0.03	0	0	mg/100g	Database [USDA]
NPO5386	NPC201284	n.a.	n.a.	0.06	0	0	mg/100g	Database [USDA]
NPO5386	NPC32441	n.a.	n.a.	53	53	53	mg/100g	Database [USDA]
NPO5386	NPC116775	n.a.	n.a.	0.4	0.4	0.4	mg/100g	Database [USDA]
NPO5386	NPC20791	n.a.	n.a.	0.5	0.5	0.5	mg/100g	Database [USDA]
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