NPASS Compound

Structure

NPC120649 OpenBabel06302216222D 22 21 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 4.3301 -7.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.1962 -7.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.1962 -6.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.3301 -5.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4.3301 -4.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.1962 -4.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6.0622 -4.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6.9282 -4.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7.7942 -4.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8.6603 -4.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9.5263 -4.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.4641 -7.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.4641 -6.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.5981 -5.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.5981 -4.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7321 -4.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.7321 -3.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8660 -2.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.8660 -1.5000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.0000 -1.0000 0.0000 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.8660 -1.5000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.0000 -0.0000 0.0000 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 2 1 0 0 0 0 1 12 2 0 0 0 0 2 3 1 0 0 0 0 3 4 1 0 0 0 0 4 5 1 0 0 0 0 5 6 1 0 0 0 0 6 7 1 0 0 0 0 7 8 1 0 0 0 0 8 9 1 0 0 0 0 9 10 1 0 0 0 0 10 11 1 0 0 0 0 12 13 1 0 0 0 0 13 14 1 0 0 0 0 14 15 1 0 0 0 0 15 16 1 0 0 0 0 16 17 1 0 0 0 0 17 18 1 0 0 0 0 18 19 1 0 0 0 0 19 20 1 0 0 0 0 20 21 1 0 0 0 0 20 22 2 0 0 0 0 M END $$$$

Physi-Chem Properties

Molecular Weight:	310.29
Volume:	366.784
LogP:	7.036
LogD:	3.704
LogS:	-3.238
# Rotatable Bonds:	17
TPSA:	37.3
# H-Bond Aceptor:	2
# H-Bond Donor:	1
# Rings:	0
# Heavy Atoms:	2

MedChem Properties

QED Drug-Likeness Score:	0.234
Synthetic Accessibility Score:	2.063
Fsp3:	0.85
Lipinski Rule-of-5:	Accepted
Pfizer Rule:	Rejected
GSK Rule:	Rejected
BMS Rule:	1
Golden Triangle Rule:	Accepted
Chelating Alert:	0
PAINS Alert:	0

ADMET Properties (ADMETlab2.0)

ADMET: Absorption

Caco-2 Permeability:	-5.073
MDCK Permeability:	3.185101377312094e-05
Pgp-inhibitor:	0.0
Pgp-substrate:	0.0
Human Intestinal Absorption (HIA):	0.043
20% Bioavailability (F20%):	0.96
30% Bioavailability (F30%):	0.996

ADMET: Distribution

Blood-Brain-Barrier Penetration (BBB):	0.013
Plasma Protein Binding (PPB):	99.8494644165039%
Volume Distribution (VD):	0.933
Pgp-substrate:	0.5004270672798157%

ADMET: Metabolism

CYP1A2-inhibitor:	0.24
CYP1A2-substrate:	0.193
CYP2C19-inhibitor:	0.253
CYP2C19-substrate:	0.067
CYP2C9-inhibitor:	0.138
CYP2C9-substrate:	0.992
CYP2D6-inhibitor:	0.021
CYP2D6-substrate:	0.154
CYP3A4-inhibitor:	0.082
CYP3A4-substrate:	0.018

ADMET: Excretion

Clearance (CL):	2.645
Half-life (T1/2):	0.767

ADMET: Toxicity

hERG Blockers:	0.082
Human Hepatotoxicity (H-HT):	0.045
Drug-inuced Liver Injury (DILI):	0.018
AMES Toxicity:	0.013
Rat Oral Acute Toxicity:	0.031
Maximum Recommended Daily Dose:	0.024
Skin Sensitization:	0.949
Carcinogencity:	0.071
Eye Corrosion:	0.928
Eye Irritation:	0.967
Respiratory Toxicity:	0.889

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Biological Activities
Similar NPs/Drugs

Natural Product: NPC120649

Natural Product ID:	NPC120649
*Common Name:**	LQJBNNIYVWPHFW-QXMHVHEDSA-N
IUPAC Name:	n.a.
Synonyms:
Standard InCHIKey:	LQJBNNIYVWPHFW-QXMHVHEDSA-N
Standard InCHI:	InChI=1S/C20H38O2/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-20(21)22/h11-12H,2-10,13-19H2,1H3,(H,21,22)/b12-11-
SMILES:	CCCCCCCCCC/C=CCCCCCCCC(=O)O
Synthetic Gene Cluster:	n.a.
ChEMBL Identifier:	n.a.
PubChem CID:	5282767
Chemical Classification:**	CHEMONTID:0000000 [Organic compounds] [CHEMONTID:0000012] Lipids and lipid-like molecules [CHEMONTID:0003909] Fatty Acyls [CHEMONTID:0000262] Fatty acids and conjugates [CHEMONTID:0002949] Long-chain fatty acids

*Note: the InCHIKey will be temporarily assigned as the "Common Name" if no IUPAC name or alternative short name is available.
**Note: the Chemical Classification was calculated by NPClassifier Version 1.5. Reference: PMID:34662515.

Species Source

Organism ID	Organism Name	Taxonomy Level	Family	SuperKingdom	Isolation Part	Collection Location	Collection Time	Reference
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	small food enterprises (Zvijezda d.d., Zagreb, Croatia)	n.a.	DOI[10.1002/EJLT.200900231]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	Nigeria(latitude 80°N and longitude 4°E)	2005; 2006	DOI[10.1002/ejlt.201000080]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		DOI[10.1002/ejlt.201100207]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11306-010-0259-y]
NPO14821	Sus scrofa domesticus	Species	Suidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11306-012-0441-5]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11306-014-0638-x]
NPO784	Sinapis alba	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	DOI[10.1007/s11418-005-0009-z]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	2007; 2008	DOI[10.1007/s11746-010-1589-7]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	Wrocław, Poland	2004–2005	DOI[10.1016/J.FOODCHEM.2006.08.014]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	retail stores, supermarkets and market stalls in Forssa and in the Helsinki area	2003–2005	DOI[10.1016/j.jfca.2006.05.007]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1016/j.phytol.2008.07.007]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	Antalya and Mugla Provinces, Turkey	200-Aug	DOI[10.1016/j.scienta.2010.10.027]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1016/S0031-9422(00)89267-5]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota		n.a.	n.a.	DOI[10.1021/jf00055a023]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	DOI[10.1021/jf950732o]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	Seeds	Plovdiv, Plovdiv region in South Bulgaria		DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		DOI[10.5219/332]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[10775096]
NPO26343	Fagopyrum esculentum	Species	Polygonaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	PMID[10898633]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[11170689]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	cotyledon	n.a.	PMID[11283027]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[11312782]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[11312782]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[11408943]
NPO22234	Ficus carica	Species	Moraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[11473446]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	PMID[11539687]
NPO24778	Sesamum orientale	Species	Pedaliaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	PMID[11540412]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[12105962]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	seed	n.a.	PMID[12670184]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[12713418]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[12802735]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[12882150]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	bark	n.a.	PMID[14727919]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	xylem	n.a.	PMID[14727919]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[14727919]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	root	n.a.	PMID[14727919]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[14727919]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	xylem	n.a.	PMID[14727919]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	root	n.a.	PMID[14727919]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	bark	n.a.	PMID[14727919]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[15019787]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	Cork, Ireland	n.a.	PMID[15223592]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[15666542]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	root	n.a.	PMID[1622242]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[16659156]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[16660462]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[16668466]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Cornell Univeristy, Ithaca		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Petone, New Zealand		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Warminster, PA		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Randolph, WI		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Shenandoah, IA		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Winslow, ME		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Cornell University, Geneva, NY		PMID[17439238]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	Seeds	Onehunga, New Zealand,		PMID[17439238]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	flower petals	n.a.	n.a.	PMID[17480100]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	rhizomes	n.a.	n.a.	PMID[18177011]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[18384095]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[18460139]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	pericarp	n.a.	PMID[18496782]
NPO7298.2	Brassica napus var. napus	Varieties	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	KWS Saat AG and NPZ Saatzucht, Germany	2004-2005	PMID[19086241]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	Esuela Tecnica Superior de Ingenieros Agrónomos de Albacete	2007	PMID[19256538]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[19271742]
NPO3478	Nelumbo nucifera	Species	Nelumbonaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[19919095]
NPO4011	Chlamydomonas reinhardtii	Species	Chlamydomonadaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[20581114]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[20590154]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[20826702]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[20963508]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[21080643]
NPO7298	Brassica napus	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	trunk bark	n.a.	PMID[21312330]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	seed	n.a.	PMID[21348467]
NPO659	Secale cereale	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[21381697]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	husk	n.a.	PMID[21574561]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[21574561]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[22014120]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[22014120]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[22014168]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22029392]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22537213]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22537213]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22537213]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22537213]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[22537213]
NPO7298	Brassica napus	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[23030806]
NPO3478	Nelumbo nucifera	Species	Nelumbonaceae	Eukaryota	flower buds and leaves	Khon Kaen province, Thailand	2010	PMID[23270663]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	PMID[23292602]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[23517479]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[23540838]
NPO3478	Nelumbo nucifera	Species	Nelumbonaceae	Eukaryota	Leaves	n.a.	n.a.	PMID[23642481]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[23759170]
NPO12323	Bos taurus	Species	Bovidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[24211545]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[24295708]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[24417583]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	Seeds	Tekirdag, Turkey		PMID[24499198]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	Stalks	n.a.	n.a.	PMID[24521157]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[25053043]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	PMID[25070365]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	leaf	n.a.	PMID[25102361]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	fruit	n.a.	PMID[25306330]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	PMID[25369450]
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NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	Leaf Essent. Oil	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota		n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	Pollen Or Spore	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	Resin, Exudate, Sap	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
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NPO22234	Ficus carica	Species	Moraceae	Eukaryota	Latex Exudate	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota		n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO41120	Nephrops norvegicus	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.		Database[FooDB]
NPO3776	Pistacia vera	Species	Anacardiaceae	Eukaryota	Seed	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	Flower Essent. Oil	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	Testa	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	Oil	n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota		n.a.	n.a.	Database[FooDB]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO24778	Sesamum orientale	Species	Pedaliaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO24342	Lupinus albus	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
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NPO1565	Lepidium sativum	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO22234	Ficus carica	Species	Moraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO8896	Anacardium occidentale	Species	Anacardiaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
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NPO7298	Brassica napus	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO784	Sinapis alba	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[HerDing]
NPO4011	Chlamydomonas reinhardtii	Species	Chlamydomonadaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[MetaboLights]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[MetaboLights]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	seed	n.a.	Database[MetaboLights]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[MetaboLights]
NPO14821	Sus scrofa domesticus	Species	Suidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[MetaboLights]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO18720	Bertholletia excelsa	Species	Lecythidaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO22782	Lens culinaris	Species	Fabaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	Oils	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	Seeds	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO366	Pyrus communis	Species	Rosaceae	Eukaryota	Fruits	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO366	Pyrus communis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
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NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO659	Secale cereale	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	Seeds	n.a.		Database[Phenol-Explorer]
NPO24778	Sesamum orientale	Species	Pedaliaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO5986	Ziziphus jujuba	Species	Rhamnaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO1565	Lepidium sativum	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO12323	Bos taurus	Species	Bovidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO366	Pyrus communis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO14821	Sus scrofa domesticus	Species	Suidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO3776	Pistacia vera	Species	Anacardiaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
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NPO27293	Sus scrofa	Species	Suidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
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NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO7298.2	Brassica napus var. napus	Varieties	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
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NPO24342	Lupinus albus	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCMID]
NPO24342	Lupinus albus	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO26343	Fagopyrum esculentum	Species	Polygonaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO5986	Ziziphus jujuba	Species	Rhamnaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO3478	Nelumbo nucifera	Species	Nelumbonaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO24778	Sesamum orientale	Species	Pedaliaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
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NPO12323	Bos taurus	Species	Bovidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TCM_Taiwan]
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NPO20553	Zingiber officinale	Species	Zingiberaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TM-MC]
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NPO784	Sinapis alba	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[TM-MC]
NPO17024	Vitis vinifera	Species	Vitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO24778	Sesamum orientale	Species	Pedaliaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO366	Pyrus communis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO19227	Hippoglossus hippoglossus	Species	Pleuronectidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO28608	Olea europaea	Species	Oleaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO27293	Sus scrofa	Species	Suidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO17213	Carya illinoinensis	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO24342	Lupinus albus	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO454	Helianthus annuus	Species	Asteraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO3776	Pistacia vera	Species	Anacardiaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO15810	Zea mays	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO22234	Ficus carica	Species	Moraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO441	Cucurbita maxima	Species	Cucurbitaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO7635	Glycine max	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO12323	Bos taurus	Species	Bovidae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO29276	Juglans nigra	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO3478	Nelumbo nucifera	Species	Nelumbonaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO25426	Arachis hypogaea	Species	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO8896	Anacardium occidentale	Species	Anacardiaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO7298	Brassica napus	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO10029	Prunus dulcis	Species	Rosaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO25114	Linum usitatissimum	Species	Linaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO18674	Juglans regia	Species	Juglandaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO26343	Fagopyrum esculentum	Species	Polygonaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO4011	Chlamydomonas reinhardtii	Species	Chlamydomonadaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO18720	Bertholletia excelsa	Species	Lecythidaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO4359	Solanum tuberosum	Species	Solanaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO659	Secale cereale	Species	Poaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO9498	Papaver somniferum	Species	Papaveraceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO22782	Lens culinaris	Species	Fabaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO784	Sinapis alba	Species	Brassicaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]
NPO10532	Pinus edulis	Species	Pinaceae	Eukaryota	n.a.	n.a.	n.a.	Database[UNPD]

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP source organism data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated them from below databases:
☉ UNPD: Universal Natural Products Database [PMID: 23638153].
☉ StreptomeDB: a database of streptomycetes natural products [PMID: 33051671].
☉ TM-MC: a database of medicinal materials and chemical compounds in Northeast Asian traditional medicine [PMID: 26156871].
☉ TCM@Taiwan: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 21253603].
☉ TCMID: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 29106634].
☉ TCMSP: The traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform [PMID: 24735618].
☉ HerDing: a herb recommendation system to treat diseases using genes and chemicals [PMID: 26980517].
☉ MetaboLights: a metabolomics database [PMID: 27010336].
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

NP Quantity Composition/Concentration

Organism ID	NP ID	Organism Material Preparation	Organism Part	NP Quantity (Standard)	NP Quantity (Minimum)	NP Quantity (Maximum)	Quantity Unit	Reference
NPO26343	NPC120649	Dried Or Powder	n.a.	4	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO29276	NPC120649	Dried Or Powder	n.a.	101	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO27293	NPC120649	No	n.a.	323	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO25426	NPC120649	Oil	n.a.	999	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO28608	NPC120649	Oil	n.a.	300	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO15810	NPC120649	Other	n.a.	100	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO18720	NPC120649	Other	n.a.	100	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO27293	NPC120649	Raw	n.a.	29	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO25426	NPC120649	n.a.	n.a.	723	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
NPO27293	NPC120649	n.a.	n.a.	160	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [DTU]
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NPO41170	NPC120649	n.a.	n.a.	2020	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO41170	NPC120649	n.a.	n.a.	2030	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO41170	NPC120649	n.a.	n.a.	2650	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO41172	NPC120649	n.a.	n.a.	51	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO454	NPC120649	n.a.	n.a.	107	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO5353	NPC120649	n.a.	n.a.	100	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7635	NPC120649	n.a.	n.a.	35	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7635	NPC120649	n.a.	n.a.	38	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8896	NPC120649	n.a.	n.a.	139	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO8896	NPC120649	n.a.	n.a.	158	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7298.2	NPC120649	n.a.	Roots	1000	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO7298.2	NPC120649	n.a.	Roots	1450	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO17024	NPC120649	ISO 659, 2009	Seeds	0.1 ± 0	n.a.	n.a.	%	DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO17024	NPC120649	ISO 659, 2009	Seeds	0.3 ± 0.01	n.a.	n.a.	%	DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO441	NPC120649	n.a.	Seeds	0.13	n.a.	n.a.	%	PMID[17439238]
NPO441	NPC120649	n.a.	Seeds	0.06	n.a.	n.a.	%	PMID[17439238]
NPO441	NPC120649	n.a.	Seeds	0.14	n.a.	n.a.	%	PMID[17439238]
NPO441	NPC120649	n.a.	Seeds	0.07	n.a.	n.a.	%	PMID[17439238]
NPO441	NPC120649	n.a.	Seeds	0.17	n.a.	n.a.	%	PMID[17439238]
NPO4359	NPC120649	n.a.	Tubers	115	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]
NPO4359	NPC120649	n.a.	Tubers	186	n.a.	n.a.	mg/100g	Database [FooDB]

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP quantitative records for specific NP domains (e.g., NPS from foods or herbs) from domain-specific databases. These databases include:
☉ DUKE: Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases.
☉ PHENOL EXPLORER: is the first comprehensive database on polyphenol content in foods [PMID: 24103452], its homepage can be accessed at here.
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

Biological Activity

Target ID	Target Type	Target Name	Target Organism	Activity Type	Activity Relation	Value	Unit	Reference

☑ Note for Activity Records:
☉ The quantitative biological activities were primarily integrated from ChEMBL (Version-30) database and were also directly collected from PubMed literature. PubMed PMID was provided as the reference link for each activity record.

Chemically structural similarity: I. Similar Active Natural Products in NPASS

Top-200 similar NPs were calculated against the active-NP-set (includes 4,3285 NPs with experimentally-derived bioactivity available in NPASS)

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules. Tc lies between [0, 1] where '1' indicates the highest similarity. What is Tanimoto coefficient

● The left chart: Distribution of similarity level between NPC120649 and all remaining natural products in the NPASS database.
● The right table: Most similar natural products (Tc>=0.56 or Top200).

range	Tanimoto Coefficient
0-0.1	138
0.1-0.2	2852
0.2-0.3	16555
0.3-0.4	12552
0.4-0.5	7039
0.5-0.6	2832
0.6-0.7	529
0.7-0.8	111
0.8-0.85	26
0.85-0.9	22
0.9-0.95	15
0.95-1	26

Similarity Score	Similarity Level	Natural Product ID

Chemically structural similarity: II. Similar Clinical/Approved Drugs

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules.

● The left chart: Distribution of similarity level between NPC120649 and all drugs/candidates.
● The right table: Most similar clinical/approved drugs (Tc>=0.56 or Top200).

range	Tanimoto Coefficient
0-0.1	116
0.1-0.2	3248
0.2-0.3	3837
0.3-0.4	1378
0.4-0.5	424
0.5-0.6	101
0.6-0.7	27
0.7-0.8	7
0.8-0.85	3
0.85-0.9	3
0.9-0.95	2
0.95-1	4

Similarity Score	Similarity Level	Drug ID	Developmental Stage

Bioactivity similarity: Similar Natural Products in NPASS

Bioactivity similarity was calculated based on bioactivity descriptors of compounds. The bioactivity descriptors were calculated by a recently developed AI algorithm Chemical Checker (CC) [Nature Biotechnology, 38:1087–1096, 2020; Nature Communications, 12:3932, 2021], which evaluated bioactivity similarities at five levels:
☉ A: chemistry similarity;
☉ B: biological targets similarity;
☉ C: networks similarity;
☉ D: cell-based bioactivity similarity;
☉ E: similarity based on clinical data.

Those 5 categories of CC bioactivity descriptors were calculated and then subjected to manifold projection using UMAP algorithm, to project all NPs on a 2-Dimensional space. The current NP was highlighted with a small circle in the 2-D map. Below figures: left-to-right, A-to-E.

A: chemistry similarity

B: biological targets similarity

C: networks similarity

D: cell-based bioactivity similarity

E: similarity based on clinical data