Natural Product: NPC99886

Natural Product IDNPC99886
Common Name
?
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 Anethole
IUPAC Name 1-methoxy-4-[(E)-prop-1-enyl]benzene
Synonyms Anethole
Synthetic Gene Cluster n.a.
ChEMBL Identifier CHEMBL452630
PubChem CID 637563
Chemical Classification
  • CHEMONTID:0000000 [Organic compounds]
    • [CHEMONTID:0002448] Benzenoids
      • [CHEMONTID:0002341] Phenol ethers
        • [CHEMONTID:0000138] Anisoles

The Chemical Classification was calculated by Classyfire, a software for chemical taxonomy calculation. Reference: DOI:10.1186/s13321-016-0174-y.

  Chemical Representations

Standard InCHIKey RUVINXPYWBROJD-ONEGZZNKSA-N
Standard InCHI InChI=1S/C10H12O/c1-3-4-9-5-7-10(11-2)8-6-9/h3-8H,1-2H3/b4-3+
SMILES C/C=C/c1ccc(cc1)OC

  Calculated Properties

Physi-Chem Properties

Molecular Weight:   148.09 Volume:   171.204
?
Van der Waals volume.
Dense:   0.865 LogP:   2.828
?
The logarithm of the n-octanol/water distribution coefficients.
logD7.4:   2.545
?
The logarithm of the n-octanol/water distribution coefficient at pH=7.4.
 LogS:   -2.799
?
The logarithm of aqueous solubility value.
Rotatable Bonds:   2.0 Rigid Bonds:   7.0
TPSA:   9.23
?
Topological Polar Surface Area.
 H-Bond Acceptor:   1.0
H-Bond Donor:   0.0 Rings:   1.0
Heavy Atoms:   1.0

MedChem Properties

QED Drug-Likeness Score:   0.626 GASA:   0.0
?
GASA represents the probability of being difficult to synthesize, ranging from 0 to 1.
Synthetic Accessibility Score:   1.653 Fsp3:   0.2
MCE-18:   5.0
?
MCE-18 stands for medicinal chemistry evolution.MCE-18≥45 is considered a suitable value.
 Lipinski Rule-of-5:   Rejected
Pfizer Rule:   Rejected GSK Rule:   Rejected
Golden Triangle Rule:   Accepted BMS Rule:   0
Chelating Alert:   0 PAINS Alert:   0
Colloidal aggregators:   0.159 Fluc inhibitor:   0.805
?
The fluc inhibitor value is the probability of being fLuc inhibitors, within the range of 0 to 1.
Blue fluorescence:   0.01
?
The blue fluorescence value is the probability of being blue fluorescence, within the range of 0 to 1
 Green fluorescence:   0.055
?
The green fluorescence value is the probability of being green fluorescence, within the range of 0 to 1
Reactive compounds:   1.0 Promiscuous compounds:   0.119

ADMET Properties (ADMETlab3.0)

ADMET: Absorption

Caco-2 Permeability:   -4.912 MDCK Permeability:   -4.684
Pgp-inhibitor:   0.888 Pgp-substrate:   0.009
PAMPA:   0.011
?
The experimental data for Peff was logarithmically transformed (logPeff). Molecules with log Peff values below 2.0 were classified as low-permeability (Category 0), while those with log Peff values exceeding 2.5 were classified as high-permeability (Category 1).
 Human Intestinal Absorption (HIA):   0.126
20% Bioavailability (F20%):   0.846 30% Bioavailability (F30%):   0.85
50% Bioavailability (F50%):   0.959

ADMET: Distribution

Blood-Brain-Barrier Penetration (BBB):   0.008 MRP1:   0.003
Plasma Protein Binding (PPB):   98.03% Volume Distribution (VD):   0.019
Fu: 1.405%
?
The fraction unbound in plasms.
 OATP1B1 inhibitor:   0.989
OATP1B3 inhibitor:   1.0 BCRP inhibitor:   0.925
BSEP inhibitor:   0.999

ADMET: Metabolism

CYP1A2-inhibitor:   0.939 CYP1A2-substrate:   0.95
CYP2C19-inhibitor:   0.402 CYP2C19-substrate:   0.86
CYP2C9-inhibitor:   0.559 CYP2C9-substrate:   0.047
CYP2D6-inhibitor:   0.98 CYP2D6-substrate:   0.635
CYP3A4-inhibitor:   0.071 CYP3A4-substrate:   0.996
CYP2B6-substrate:   0.268 CYP2C8-inhibitor:   1.0
HLM stability:   0.743
?
Human liver microsomal (HLM) stability. Category 0: stable+ (HLM > 30 min); Category 1: unstable- (HLM ≤ 30 min). The output value is the probability of human liver microsomal instability, where a value closer to 1 indicates a higher likelihood of instability.

ADMET: Excretion

Clearance (CL):  10.48 Half-life (T1/2):  0.713

ADMET: Toxicity

hERG Blockers:  0.263 hERG Blockers (10um):  0.526
Human Hepatotoxicity (H-HT):  0.533 Drug-induced Liver Injury (DILI):  0.318
AMES Toxicity:  0.495 Rat Oral Acute Toxicity:  0.172
Maximum Recommended Daily Dose:  0.183 Skin Sensitization:  0.885
Carcinogencity:  0.563 Eye Corrosion:  0.963
Eye Irritation:  0.993 Respiratory Toxicity:  0.689
Drug-induced Neurotoxicity:  0.716 Ototoxicity:  0.19
Hematotoxicity:  0.212 Drug-induced Nephrotoxicity:  0.36
Genotoxicity:  0.033 RPMI-8226 Immunitoxicity:  0.074
A549 Cytotoxicity:  0.126 Hek293 Cytotoxicity:  0.172
BCF:   2.501
?
Bioconcentration factors are used for considering secondary poisoning potential and assessing risks to human health via the food chain. The unit is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
 IGC50:   3.611
?
48 hour Tetrahymena pyriformis IGC50. The unit of IGC50 is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
LC50DM:   7.529
?
48 hour Daphnia magna LC50. The unit of LC50DM is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
 LC50FM:   7.244
?
96 hour fathead minnow LC50. The unit of LC50FM is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].

  Species Source

Organism ID Organism Name Taxonomy Level Family SuperKingdom Isolation Part Collection Location Collection Time Reference
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Seeds n.a. DOI[10.1002/(SICI)1097-0010(199909)79:12<1620::AID-JSFA410>3.0.CO;2-G]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1007/s00217-002-0656-1]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1007/s00217-015-2561-4]
NPO7154 Glycyrrhiza uralensis Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11164-015-2099-x]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-014-0642-1]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. root n.a. DOI[10.1007/s11418-007-0221-0]
NPO29384 Glycyrrhiza glabra Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s40502-015-0143-x]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/0031-9422(83)80138-1]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.diagmicrobio.2016.03.012]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. DOI[10.1016/j.foodchem.2007.07.014]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. DOI[10.1016/j.foodchem.2010.05.061]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1016/j.foodchem.2010.05.061]
NPO12620 Carum carvi Species Apiaceae Eukaryota n.a. seed n.a. DOI[10.1016/j.indcrop.2012.04.060]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1016/j.indcrop.2013.08.051]
NPO20414 Ocimum basilicum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.indcrop.2020.112278]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. DOI[10.1016/j.ssnmr.2006.05.001]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1016/j.yclnex.2017.01.002; 10.31989/ffhd.v6i3.245]DOI[10.1016/j.yclnex.2017.01.002; 10.31989/ffhd.v6i3.245]
NPO28295 Foeniculum vulgare Species Apiaceae Eukaryota n.a. leaf n.a. DOI[10.1016/S0031-9422(00)94055-X]
NPO12620 Carum carvi Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/S0031-9422(02)00288-1]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/S1570-0232(03)00281-2]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1021/ac300829f]
NPO22741 Curcuma kwangsiensis Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. rhizome n.a. DOI[10.1021/np100392m]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1038/nbt.2488]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1046/j.1471-0528.2003.02041.x]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1074/jbc.M601876200]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1080/09064710.2011.598543]
NPO29109 Clausena anisata Species Rutaceae Eukaryota n.a. leaf n.a. DOI[10.1080/10412905.1999.9701119]
NPO29109 Clausena anisata Species Rutaceae Eukaryota n.a. seed n.a. DOI[10.1080/10412905.1999.9701119]
NPO29384 Glycyrrhiza glabra Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1093/pcp/pcg054]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1111/j.1365-2621.1989.tb04709.x]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.1111/j.1745-4530.2009.00507.x]
NPO29384 Glycyrrhiza glabra Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1134/S1021443709050069]
NPO7154 Glycyrrhiza uralensis Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1134/S1021443711030101]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1371/journal.pone.0115359]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.15835/NBHA4017181]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.17221/540/2012-CJFS]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.2137/145960607781635822]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.2478/aoas-2014-0072]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.3136/NSKKK.48.606]
NPO28295 Foeniculum vulgare Species Apiaceae Eukaryota n.a. flower n.a. DOI[10.3390/70200245]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota Fruits n.a. DOI[10.3390/agriculture2030244]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10027644]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10063930]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. saliva n.a. PMID[10080645]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10082779]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10084574]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10102915]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[1016232]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10197568]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10214695]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10222355]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10342082]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10353310]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10379660]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10384376]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10388475]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10400457]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10404733]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10468933]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10490504]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. pericardial effusion n.a. PMID[10499868]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10508118]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10509899]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10553002]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10553836]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10577274]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10577998]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10588216]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10609336]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10624837]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10638943]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10649708]
NPO29109 Clausena anisata Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10650093]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10656535]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10683228]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10692117]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10698679]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10704102]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10705477]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10722890]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10731506]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10731506]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10759475]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10775436]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10791960]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10828258]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10833489]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10855991]
NPO14112 Uncaria rhynchophylla Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10869194]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10877011]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10887501]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10901139]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10901139]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10940350]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10946022]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10947201]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10960829]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11017945]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11034610]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11146090]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11160372]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. bile n.a. PMID[11160372]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11166796]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11181130]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11192938]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[11197147]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[11199218]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[11204211]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11212875]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11255442]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[11262151]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11293697]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[11315839]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11316487]
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NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36235238]
NPO20414 Ocimum basilicum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36270431]
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NPO21460 Anethum graveolens Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36432786]
NPO23017 Urtica dioica Species Urticaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36447306]
NPO12297 Nigella sativa Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36677629]
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NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO20414 Ocimum basilicum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO4626 Pimpinella anisum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO42013 Foeniculum vulgare Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO12620 Carum carvi Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO21460 Anethum graveolens Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36840093]
NPO3987 Syzygium aromaticum Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36985392]
NPO10742 Galium verum Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36985838]
NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37020229]
NPO8698 Zanthoxylum schinifolium Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37029634]
NPO5315 Zanthoxylum bungeanum Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37029634]
NPO5315 Zanthoxylum bungeanum Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37049761]
NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37049808]
NPO44148 Alcea glabrata Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37119859]
NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37175125]
NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37226152]
NPO2345 Coriandrum sativum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37331322]
NPO4626 Pimpinella anisum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37379658]
NPO56489 Phagnalon sinaicum Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37395489]
NPO31458 Cinnamomum cassia Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37446712]
NPO4626 Pimpinella anisum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37446712]
NPO42013 Foeniculum vulgare Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37488427]
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NPO21460 Anethum graveolens Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37653914]
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NPO3987 Syzygium aromaticum Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37836118]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3791712]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3793734]
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NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38381096]
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NPO4570 Myrtus communis Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38686775]
NPO31458 Cinnamomum cassia Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38688144]
NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38695450]
NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38695450]
NPO21460 Anethum graveolens Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38719900]
NPO2345 Coriandrum sativum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38719900]
NPO20414 Ocimum basilicum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38744893]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38783072]
NPO13274 Illicium verum Species Schisandraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38790803]
NPO44905 Agastache foeniculum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38791403]
NPO26351 Agastache rugosa Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38791403]
NPO47860 Gonystylus bancanus Species Thymelaeaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38802441]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38893452]
NPO7247 Cymbopogon citratus Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38931371]
NPO1085 Peganum harmala Species Nitrariaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38971075]
NPO11213 Terminalia arjuna Species Combretaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39034926]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39065529]
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NPO12297 Nigella sativa Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39519627]
NPO52418 Heracleum persicum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39519893]
NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39520005]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3958083]
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NPO29384 Glycyrrhiza glabra Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39683057]
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NPO558 Limnophila rugosa Species Limoniidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29169 Origanum vulgare Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO21460 Anethum graveolens Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1698 Glycyrrhiza inflata Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO24390 Juniperus rigida Species Cupressaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15890 Cimicifuga foetida Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26351 Agastache rugosa Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3987 Syzygium aromaticum Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7154 Glycyrrhiza uralensis Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13970 Caryopteris mongholica Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10551 Acanthopanax ricinifolius n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12693 Mesembryanthemum tortuosum Species Aizoaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5315 Zanthoxylum bungeanum Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18379 Satureja atropatana Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11170 Akebia trifoliata Species Lardizabalaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15294 Magnolia salicifolia Species Magnoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12620 Carum carvi Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11421 Arnebia euchroma Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO28688 Aster tataricus Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8255 Cinnamomum aromaticum Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7027 Metapenaeus macleayi Species Penaeidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO6519 Calocera viscosa Species Dacrymycetaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12181 Albizia julibrissin Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13368 Monomorium delagoense Species Formicidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO28295 Foeniculum vulgare Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10773 Dalbergia rubiginosa Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13274 Illicium verum Species Schisandraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5911 Anchusa officinalis Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7929 Curcuma zedoaria Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5531 Protoceratium reticulatum Species Gonyaulacaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14260 Euphorbia kansui Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14465 Ramalina terebrata Species Ramalinaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19472 Thymus vulgaris Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16137 Mappia foetida Species Icacinaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8896 Anacardium occidentale Species Anacardiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2618 Curcuma wenyujin Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20297 Arnebia guttata Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO25825 Saussurea lappa Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO28260 Senna alexandrina Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12468 Asarum heterotropoides Species Aristolochiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16626 Leucetta microrhaphis Species Leucettidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO389 Actaea heracleifolia Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20414 Ocimum basilicum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19649 Akebia quinata Species Lardizabalaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4626 Pimpinella anisum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10079 Chloropyron maritimum Species Orobanchaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12297 Nigella sativa Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13989 Uncaria macrophylla Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29352 Uncaria sinensis Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9290 Zanthoxylum piperitum Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29384 Glycyrrhiza glabra Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7269 Aronia melanocarpa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18007 Agrimonia pilosa Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO22741 Curcuma kwangsiensis Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO22848 Kaempferia galanga Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18068 Curcuma phaeocaulis Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12940 Briareum stechei Species Briareidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10742 Galium verum Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7247 Cymbopogon citratus Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15373 Actaea dahurica Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO906 Artemisia verlotorum Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14112 Uncaria rhynchophylla Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16403 Diabrotica undecimpunctata Species Chrysomelidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12935 Thymus quinquecostatus Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1085 Peganum harmala Species Nitrariaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8698 Zanthoxylum schinifolium Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2727 Actaea simplex Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2450 Rosa parviflora Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4570 Myrtus communis Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16039 Scutellaria barbata Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15170 Parthenium hysterophorus Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10261 Helichrysum glomeratum Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7115 Stetsonia coryne Species Cactaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO6583 Clematis chinensis Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2345 Coriandrum sativum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15357 Stevia sarensis Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP source organism data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated them from below databases:
☉ UNPD: Universal Natural Products Database [PMID: 23638153].
☉ StreptomeDB: a database of streptomycetes natural products [PMID: 33051671].
☉ TM-MC: a database of medicinal materials and chemical compounds in Northeast Asian traditional medicine [PMID: 26156871].
☉ TCM@Taiwan: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 21253603].
☉ TCMID: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 29106634].
☉ TCMSP: The traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform [PMID: 24735618].
☉ HerDing: a herb recommendation system to treat diseases using genes and chemicals [PMID: 26980517].
☉ MetaboLights: a metabolomics database [PMID: 27010336].
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].



  NP Quantity Composition/Concentration

Organism ID Organism Name Organism Material Preparation Organism Part NP Quantity (Standard) NP Quantity (Minimum) NP Quantity (Maximum) Quantity Unit Reference
NPO10742 Galium verum n.a. n.a. 1.1 n.a. n.a. % PMID[36985838]
NPO1085 Peganum harmala Headspace n.a. 7.91 n.a. n.a. % PMID[38971075]
NPO1085 Peganum harmala Liquid-liquid extraction n.a. 15.7 n.a. n.a. % PMID[38971075]
NPO11213 Terminalia arjuna Oil Bark 8.37 n.a. n.a. % PMID[39034926]
NPO12297 Nigella sativa Oil n.a. 2.3 n.a. n.a. % PMID[36128855]
NPO12620 Carum carvi Oil n.a. 0.90 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO12935 Thymus quinquecostatus Oil n.a. 5.324 n.a. n.a. % PMID[34453492]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 3.93 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 1.32 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 1.45 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 21.63 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 15.27 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 1.33 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 8.77 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13182 Achillea wilhelmsii Oil n.a. 0.56 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO13274 Illicium verum Oil n.a. 88.4 n.a. n.a. % PMID[38790803]
NPO19472 Thymus vulgaris Oil n.a. 0.22 n.a. n.a. % PMID[34770961]
NPO20414 Ocimum basilicum Oil n.a. 3.09 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO21460 Anethum graveolens Oil n.a. 0.2 n.a. n.a. % PMID[30551419]
NPO21460 Anethum graveolens Oil n.a. 0.19 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO23017 Urtica dioica Acetone extract n.a. 0.41 n.a. n.a. % PMID[39696148]
NPO29169 Origanum vulgare CO2 extract n.a. 0.145 n.a. n.a. mg/g PMID[35608311]
NPO29169 Origanum vulgare Oil n.a. 16.04 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO31458 Cinnamomum cassia Oil Bark 0.12 n.a. n.a. % PMID[38688144]
NPO31458 Cinnamomum cassia Oil n.a. 0.21 n.a. n.a. % PMID[34332066]
NPO33477 Crithmum maritimum Oil n.a. 4.4 n.a. n.a. % PMID[39065529]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 36.31 ± 0.86 n.a. n.a. % PMID[31368565]
NPO42013 Foeniculum vulgare n.a. n.a. 1.96786 n.a. n.a. mg/100mL Database [Phenol-Explorer]
NPO42013 Foeniculum vulgare Steam distillation Seeds 62.38±0.02 n.a. n.a. % PMID[39723073]
NPO42013 Foeniculum vulgare Superheated steam extraction Seeds 66.46±0.01 n.a. n.a. % PMID[39723073]
NPO42013 Foeniculum vulgare Hydro distillation Seeds 58.48±0.03 n.a. n.a. % PMID[39723073]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 73.85 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 81.3 n.a. n.a. % PMID[37626070]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 74.03±1.55 n.a. n.a. % PMID[37488427]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 74.88 ± 0.55 n.a. n.a. % PMID[31368565]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 63.41 ± 0.58 n.a. n.a. % PMID[31368565]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 78.26 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[31368565]
NPO42013 Foeniculum vulgare Oil n.a. 0.14 ± 0.15 n.a. n.a. % PMID[31368565]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 3.24 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 1.58 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 1.8 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 0 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 37.63 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 3.06 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 0.28 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO42417 Achillea vermicularis Oil n.a. 1.1 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO44148 Alcea glabrata Oil n.a. 12.0 n.a. n.a. % PMID[37119859]
NPO44905 Agastache foeniculum Oil n.a. 0.09 n.a. n.a. % PMID[38791403]
NPO4570 Myrtus communis Oil n.a. 0.56 n.a. n.a. % PMID[38686775]
NPO46140 Epilobium angustifolium Oil n.a. 1.94 ± 0.095 n.a. n.a. % PMID[34885770]
NPO4626 Pimpinella anisum Oil n.a. 96.40 n.a. n.a. % PMID[36840093]
NPO4626 Pimpinella anisum Oil n.a. 80.10 ± 0.03 n.a. n.a. % PMID[37379658]
NPO4626 Pimpinella anisum Oil n.a. 91.57±0.02 n.a. n.a. % PMID[37379658]
NPO4626 Pimpinella anisum Oil n.a. 89.71±0.03 n.a. n.a. % PMID[37379658]
NPO4626 Pimpinella anisum Oil n.a. 78.51 n.a. n.a. % PMID[37446712]
NPO47856 Ansellia africana n.a. n.a. 0.78 n.a. n.a. % PMID[31140321]
NPO47860 Gonystylus bancanus Oil n.a. 1.91 n.a. n.a. % PMID[38802441]
NPO52179 Osmorhiza occidentalis Oil n.a. 1.1 n.a. n.a. % PMID[36297715]
NPO52179 Osmorhiza occidentalis Oil n.a. 0.9 n.a. n.a. % PMID[36297715]
NPO52418 Heracleum persicum Oil n.a. 1.0 ± 0.0 n.a. n.a. % PMID[39519893]
NPO53530 Phlomis floccosa Oil n.a. 0.5 n.a. n.a. % PMID[31116451]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 44.5 n.a. n.a. % PMID[30632261]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 16.67 n.a. n.a. % PMID[33410338]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 11.59 n.a. n.a. % PMID[33410338]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 5.30 n.a. n.a. % PMID[33410338]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 0.76 n.a. n.a. % PMID[33410338]
NPO54641 Foeniculum vulgare subsp. vulgare Oil n.a. 42.8 n.a. n.a. % PMID[30632261]
NPO56320 Pinus ponderosa var. ponderosa Oil n.a. 2.3 n.a. n.a. % PMID[36080426]
NPO56320 Pinus ponderosa var. ponderosa Oil n.a. 1.6 n.a. n.a. % PMID[36080426]
NPO56320 Pinus ponderosa var. ponderosa Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[36080426]
NPO56489 Phagnalon sinaicum Oil Aerial parts 0.47 n.a. n.a. % PMID[37395489]
NPO56848 horchata lojana Oil n.a. 32.2 ± 0.25 n.a. n.a. % PMID[32736051]
NPO56848 horchata lojana Oil n.a. 22.8 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[32736051]
NPO56848 horchata lojana Oil n.a. 0.8 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[32736051]
NPO58636 Genista tridentata Oil Flowers 4.7 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO59176 Teucrium Capitatum L. Subsp. Lusitanicum Oil n.a. 0.3 n.a. n.a. % PMID[33230534]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 1.71 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 1.39 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 2.2 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 2.1 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 1.14 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 0.8 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64307 Achillea tenuifolia Oil n.a. 1.85 n.a. n.a. % PMID[38783072]
NPO64423 Bupleurum plantagineum Oil Leaves 4.9 ± 0.2 n.a. n.a. % PMID[38315576]
NPO7247 Cymbopogon citratus Oil n.a. 0.03 n.a. n.a. % PMID[34332066]
NPO7269 Aronia melanocarpa Hydro distillation Fruits 6.1 n.a. n.a. % PMID[38893452]

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP quantitative records for specific NP domains (e.g., NPS from foods or herbs) from domain-specific databases. These databases include:
☉ DUKE: Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases.
☉ PHENOL EXPLORER: is the first comprehensive database on polyphenol content in foods [PMID: 24103452], its homepage can be accessed at here.
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].



 Biological Activity

Molecular-level activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference
NPT153 Individual protein Androgen Receptor Homo sapiens Potency n.a. 1.3 nM PubChem BioAssay data set
NPT152 Individual protein Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 Homo sapiens Potency n.a. 62438.4 nM PubChem BioAssay data set
NPT106 Individual protein Peroxisome proliferator-activated receptor delta Homo sapiens Potency n.a. 158.2 nM PubChem BioAssay data set
NPT72 Individual protein Solute carrier organic anion transporter family member 1B3 Homo sapiens Inhibition = 124.13 % PMID[23571415]
NPT48 Individual protein Lysine-specific demethylase 4D-like Homo sapiens Potency = 35481.3 nM PubChem BioAssay data set
NPT94 Individual protein Aldehyde dehydrogenase 1A1 Homo sapiens Potency = 39810.7 nM PubChem BioAssay data set
NPT73 Individual protein Solute carrier organic anion transporter family member 1B1 Homo sapiens Inhibition = 89.5 % PMID[23571415]

In vitro activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference
NPT82 Cell line MDA-MB-231 Homo sapiens Activity = 60.0 % PMID[36858050]
NPT1031 Cell line Ca9-22 Homo sapiens Activity = 42.7 % PMID[36858050]
NPT2351 Cell line MG-63 Homo sapiens GI50 = 60250.0 nM PMID[36858050]
NPT1031 Cell line Ca9-22 Homo sapiens Activity = 5.2 % PMID[36858050]
NPT2242 Organism Penicillium chrysogenum Penicillium chrysogenum MIC > 800.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT878 Organism Streptococcus mutans Streptococcus mutans MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT312 Organism Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[8463795]
NPT767 Organism Pichia jadinii Cyberlindnera jadinii MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT79 Organism Bacillus subtilis Bacillus subtilis MIC = 400.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT20 Organism Candida albicans Candida albicans MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[8463795]
NPT450 Organism Meloidogyne incognita Meloidogyne incognita EC50 = 124.0 ug.mL-1 PMID[20527965]
NPT450 Organism Meloidogyne incognita Meloidogyne incognita EC50 = 140.0 ug.mL-1 PMID[20527965]
NPT450 Organism Meloidogyne incognita Meloidogyne incognita EC50 = 170.0 ug.mL-1 PMID[20527965]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MFC = 1600.0 ug ml-1 PMID[15969495]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MIC = 1600.0 ug.mL-1 PMID[15969495]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MIC = 800.0 ug.mL-1 PMID[15969495]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MIC = 400.0 ug.mL-1 PMID[15969495]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MIC = 100.0 ug.mL-1 PMID[15969495]
NPT774 Organism Zygosaccharomyces bailii Zygosaccharomyces bailii MFC = 200.0 ug ml-1 PMID[15969495]
NPT20 Organism Candida albicans Candida albicans MIC = 6740000.0 nM DOI[10.1007/s00044-013-0484-9]
NPT4924 Organism Haemonchus contortus Haemonchus contortus IC50 = 4650000.0 nM PMID[28231520]
NPT4924 Organism Haemonchus contortus Haemonchus contortus IC50 = 14230000.0 nM PMID[28231520]
NPT16 Organism Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus MIC > 800.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT18 Organism Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa MIC > 800.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT523 Organism Malassezia furfur Malassezia furfur MIC = 100.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT2539 Organism Corynebacterium ammoniagenes Corynebacterium ammoniagenes MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT19 Organism Escherichia coli Escherichia coli MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT523 Organism Malassezia furfur Malassezia furfur MIC = 200.0 ug.mL-1 PMID[8463795]
NPT187 Organism Issatchenkia orientalis Pichia kudriavzevii MIC = 6740000.0 nM DOI[10.1007/s00044-013-0484-9]
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 1.6 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 1.4 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 62438.4 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 30.6 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 1110.3 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 5.4 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 49596.6 nM PubChem BioAssay data set
NPT720 Organism Enterobacter aerogenes Enterobacter aerogenes MIC > 800.0 ug.mL-1 PMID[1517735]
NPT167 Organism Propionibacterium acnes Propionibacterium acnes MIC = 100.0 ug.mL-1 PMID[8158169]
NPT522 Organism Abutilon theophrasti Abutilon theophrasti Activity = 95.0 % DOI[10.1021/np50043a024]
NPT522 Organism Abutilon theophrasti Abutilon theophrasti Activity = 100.0 % DOI[10.1021/np50043a024]
NPT522 Organism Abutilon theophrasti Abutilon theophrasti Activity = 98.0 % DOI[10.1021/np50043a024]

In vivo activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference





 Experimental ADME

Experiment Model Experiment Tissue ADME Type ADME Relation ADME Value ADME Unit Reference





 Experimental Toxicity

Quantitative toxicity

Experiment Model Experiment Organism Toxicity Type Toxicity Relation Toxicity Value Toxicity Unit Reference

Common Abbreviations:
LC: Lethal Concentration; LD: Lethal Dose; LT:Lethal Time; NOAEL: No-observed-adverse-effect Level; BMDL: Benchmark Dose Lower Confidence Limit; BMD: Benchmark Dose; BMC:Benchmark Concentration; LOAEL: Lowest Observed Adverse Effect Level; RfD:Reference Dose; RfC:Reference Concentration; MRL: Minimal Risk Level; MEG: Maximum Exposure Guideline; PAC: Protective Action Criteria

Categorical toxicity labels

Hepatotoxicity Carcinogenicity Mutagenicity Cardiotoxicity Respiratory Toxicity Eye Irritation Endocrine Disruption
Hepatotoxicity Carcinogenicity Mutagenicity Cardiotoxicity Respiratory Toxicity Eye Irritation Endocrine Disruption

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP toxicity records from domain-specific databases. These databases include:
☉ ToxValDB: a curated database that compiles quantitative toxicity values for chemicals from diverse public sources to support toxicological research and risk assessment.
☉ TOXRIC: a comprehensive, free-to-access, online database providing toxicological/feature data. The toxicity labels are retrieved from this database. [PMID: 36400569]


  Chemically structural similarity

Similar Active Natural Products in NPASS

Top-200 similar NPs were calculated against the active-NP-set (includes approximately 50,000 NPs with experimentally-derived bioactivity available in NPASS)

Similarity is measured using the Tanimoto coefficient (Tc) , which compares the binary fingerprints of two molecules. Tc is calculated as the intersection divided by the union of '1' bits in the fingerprints, ranging from 0 to 1, with 1 indicating highest similarity.

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC99886 and all remaining natural products in the NPASS database.
●  The right table: Most similar natural products (Tc>=0.5 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Natural Product ID
1.0 High Similarity NPC259134
1.0 High Similarity NPC8002
0.75 Intermediate Similarity NPC175298
0.7143 Intermediate Similarity NPC13755
0.6897 Remote Similarity NPC310905
0.6667 Remote Similarity NPC4718
0.6176 Remote Similarity NPC179686
0.6061 Remote Similarity NPC245552
0.5676 Remote Similarity NPC258171
0.5676 Remote Similarity NPC94347
0.5556 Remote Similarity NPC211120
0.5455 Remote Similarity NPC2518
0.5405 Remote Similarity NPC176930
0.5405 Remote Similarity NPC485640
0.5405 Remote Similarity NPC602047
0.5385 Remote Similarity NPC471581
0.5357 Remote Similarity NPC183648
0.5333 Remote Similarity NPC203924
0.5312 Remote Similarity NPC82016
0.5185 Remote Similarity NPC57879
0.5185 Remote Similarity NPC177844
0.5128 Remote Similarity NPC139813

Similar Clinical/Approved Drugs

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules.

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC99886 and all drugs/candidates.
●  The right table: Most similar clinical/approved drugs (Tc>=0.5 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Drug ID Developmental Stage
0.5385 Remote Similarity NPD1358 Phase 4

Bioactivity similarity

  Bioactivity similarity

Similar Natural Products in NPASS

Similarity level is defined by Bioactivity similarity was calculated based on bioactivity descriptors of compounds. The bioactivity descriptors were calculated by a recently developed AI algorithm Chemical Checker (CC) [Nature Biotechnology, 38:1087–1096, 2020; Nature Communications, 12:3932, 2021], which evaluated bioactivity similarities at five levels:
☉ A: chemistry similarity;
☉ B: biological targets similarity;
☉ C: networks similarity;
☉ D: cell-based bioactivity similarity;
☉ E: similarity based on clinical data.
Those 5 categories of CC bioactivity descriptors were calculated and then subjected to manifold projection using UMAP algorithm, to project all NPs on a 2-Dimensional space. The current NP was highlighted with a small circle in the 2-D map. Below figures: left-to-right, A-to-E.

A: chemistry similarity
B: biological targets similarity
C: networks similarity
D: cell-based bioactivity similarity
E: similarity based on clinical data