Natural Product: NPC208075

Natural Product IDNPC208075
Common Name
?
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 Phenylacetaldehyde
IUPAC Name 2-phenylacetaldehyde
Synonyms
Synthetic Gene Cluster n.a.
ChEMBL Identifier CHEMBL1233464
PubChem CID 998
Chemical Classification
  • CHEMONTID:0000000 [Organic compounds]
    • [CHEMONTID:0002448] Benzenoids
      • [CHEMONTID:0002279] Benzene and substituted derivatives
        • [CHEMONTID:0001257] Phenylacetaldehydes

The Chemical Classification was calculated by Classyfire, a software for chemical taxonomy calculation. Reference: DOI:10.1186/s13321-016-0174-y.

  Chemical Representations

Standard InCHIKey DTUQWGWMVIHBKE-UHFFFAOYSA-N
Standard InCHI InChI=1S/C8H8O/c9-7-6-8-4-2-1-3-5-8/h1-5,7H,6H2
SMILES c1ccc(cc1)CC=O

  Calculated Properties

Physi-Chem Properties

Molecular Weight:   120.06 Volume:   136.612
?
Van der Waals volume.
Dense:   0.879 LogP:   1.699
?
The logarithm of the n-octanol/water distribution coefficients.
logD7.4:   1.856
?
The logarithm of the n-octanol/water distribution coefficient at pH=7.4.
 LogS:   -1.778
?
The logarithm of aqueous solubility value.
Rotatable Bonds:   2.0 Rigid Bonds:   7.0
TPSA:   17.07
?
Topological Polar Surface Area.
 H-Bond Acceptor:   1.0
H-Bond Donor:   0.0 Rings:   1.0
Heavy Atoms:   1.0

MedChem Properties

QED Drug-Likeness Score:   0.539 GASA:   0.0
?
GASA represents the probability of being difficult to synthesize, ranging from 0 to 1.
Synthetic Accessibility Score:   1.706 Fsp3:   0.125
MCE-18:   4.0
?
MCE-18 stands for medicinal chemistry evolution.MCE-18≥45 is considered a suitable value.
 Lipinski Rule-of-5:   Rejected
Pfizer Rule:   Rejected GSK Rule:   Rejected
Golden Triangle Rule:   Accepted BMS Rule:   1
Chelating Alert:   0 PAINS Alert:   0
Colloidal aggregators:   0.018 Fluc inhibitor:   0.001
?
The fluc inhibitor value is the probability of being fLuc inhibitors, within the range of 0 to 1.
Blue fluorescence:   0.033
?
The blue fluorescence value is the probability of being blue fluorescence, within the range of 0 to 1
 Green fluorescence:   0.085
?
The green fluorescence value is the probability of being green fluorescence, within the range of 0 to 1
Reactive compounds:   1.0 Promiscuous compounds:   0.098

ADMET Properties (ADMETlab3.0)

ADMET: Absorption

Caco-2 Permeability:   -4.417 MDCK Permeability:   -4.221
Pgp-inhibitor:   0.671 Pgp-substrate:   0.009
PAMPA:   0.109
?
The experimental data for Peff was logarithmically transformed (logPeff). Molecules with log Peff values below 2.0 were classified as low-permeability (Category 0), while those with log Peff values exceeding 2.5 were classified as high-permeability (Category 1).
 Human Intestinal Absorption (HIA):   0.007
20% Bioavailability (F20%):   0.347 30% Bioavailability (F30%):   0.453
50% Bioavailability (F50%):   0.481

ADMET: Distribution

Blood-Brain-Barrier Penetration (BBB):   0.696 MRP1:   0.257
Plasma Protein Binding (PPB):   69.102% Volume Distribution (VD):   0.107
Fu: 27.043%
?
The fraction unbound in plasms.
 OATP1B1 inhibitor:   0.536
OATP1B3 inhibitor:   0.902 BCRP inhibitor:   0.058
BSEP inhibitor:   0.913

ADMET: Metabolism

CYP1A2-inhibitor:   0.055 CYP1A2-substrate:   0.958
CYP2C19-inhibitor:   0.42 CYP2C19-substrate:   0.24
CYP2C9-inhibitor:   0.17 CYP2C9-substrate:   0.016
CYP2D6-inhibitor:   0.002 CYP2D6-substrate:   0.026
CYP3A4-inhibitor:   0.113 CYP3A4-substrate:   0.437
CYP2B6-substrate:   0.029 CYP2C8-inhibitor:   0.801
HLM stability:   0.569
?
Human liver microsomal (HLM) stability. Category 0: stable+ (HLM > 30 min); Category 1: unstable- (HLM ≤ 30 min). The output value is the probability of human liver microsomal instability, where a value closer to 1 indicates a higher likelihood of instability.

ADMET: Excretion

Clearance (CL):  8.974 Half-life (T1/2):  2.138

ADMET: Toxicity

hERG Blockers:  0.147 hERG Blockers (10um):  0.583
Human Hepatotoxicity (H-HT):  0.199 Drug-induced Liver Injury (DILI):  0.61
AMES Toxicity:  0.45 Rat Oral Acute Toxicity:  0.13
Maximum Recommended Daily Dose:  0.142 Skin Sensitization:  0.994
Carcinogencity:  0.202 Eye Corrosion:  0.977
Eye Irritation:  0.994 Respiratory Toxicity:  0.533
Drug-induced Neurotoxicity:  0.759 Ototoxicity:  0.108
Hematotoxicity:  0.122 Drug-induced Nephrotoxicity:  0.601
Genotoxicity:  0.307 RPMI-8226 Immunitoxicity:  0.033
A549 Cytotoxicity:  0.036 Hek293 Cytotoxicity:  0.103
BCF:   1.058
?
Bioconcentration factors are used for considering secondary poisoning potential and assessing risks to human health via the food chain. The unit is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
 IGC50:   3.884
?
48 hour Tetrahymena pyriformis IGC50. The unit of IGC50 is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
LC50DM:   4.405
?
48 hour Daphnia magna LC50. The unit of LC50DM is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].
 LC50FM:   4.144
?
96 hour fathead minnow LC50. The unit of LC50FM is -log10[(mg/L)/(1000*MW)].

  Species Source

Organism ID Organism Name Taxonomy Level Family SuperKingdom Isolation Part Collection Location Collection Time Reference
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. Nigeria(latitude 80°N and longitude 4°E) 2005; 2006 DOI[10.1002/ejlt.201000080]
NPO1515 Lonicera japonica Species Caprifoliaceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.1002/elan.200403102]
NPO9445 Crocus sativus Species Iridaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1002/hlca.19270100148]
NPO15810 Zea mays Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/BF00714468]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11240-015-0761-z]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-010-0259-y]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-014-0638-x]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-014-0642-1]
NPO784 Sinapis alba Species Brassicaceae Eukaryota n.a. seed n.a. DOI[10.1007/s11418-005-0009-z]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. root n.a. DOI[10.1007/s11418-007-0221-0]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s12010-013-0354-4]
NPO21658 Saccharomyces cerevisiae Species Saccharomycetaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/0003-9861(62)90112-1]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/0006-291X(79)91731-5]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/0031-9422(83)80138-1]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. DOI[10.1016/0045-6535(91)90110-Y]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.abb.2017.09.009]
NPO4640 Portulaca oleracea Species Portulacaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.carres.2012.01.012]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.diagmicrobio.2016.03.012]
NPO20440 Chrysanthemum x morifolium Species Asteraceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.1016/j.foodchem.2009.03.042]
NPO1515 Lonicera japonica Species Caprifoliaceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.1016/j.foodchem.2012.02.124]
NPO29401 Bupleurum chinense Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.indcrop.2008.08.002]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jarmap.2018.11.004]
NPO20553 Zingiber officinale Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jarmap.2018.11.004]
NPO28276 Artemisia argyi Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jep.2005.01.054]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jfca.2004.07.004]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jfca.2005.08.001]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jfca.2005.08.001]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. retail stores, supermarkets and market stalls in Forssa and in the Helsinki area 2003–2005 DOI[10.1016/j.jfca.2006.05.007]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. retail stores, supermarkets and market stalls in Forssa and in the Helsinki area 2003–2005 DOI[10.1016/j.jfca.2006.05.007]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.jplph.2011.12.019]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.phytol.2008.07.007]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/S0885-5765(05)80069-4]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/S1570-0232(03)00281-2]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1021/ac300829f]
NPO15810 Zea mays Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. DOI[10.1021/jf00055a023]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1038/nbt.2488]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1046/j.1471-0528.2003.02041.x]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota Seeds Plovdiv, Plovdiv region in South Bulgaria DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1055/S-2006-958077]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1074/jbc.M601876200]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. DOI[10.1093/emboj/18.8.2021]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1093/jxb/erx356]
NPO29007 Brassica juncea Species Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1155/2014/726070]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1172/JCI16309]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1186/s40064-015-0831-z]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1371/journal.pone.0115359]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1371/journal.pone.0115359]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1501/Tarimbil_0000001065]
NPO20440 Chrysanthemum x morifolium Species Asteraceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.3136/fstr.15.499]
NPO20440 Chrysanthemum x morifolium Species Asteraceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.5897/AJB10.140]
NPO20440 Chrysanthemum x morifolium Species Asteraceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.5897/AJB2010.000-3252]
NPO22258 Chrysanthemum indicum Species Asteraceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. DOI[10.5897/JMPR.9000078]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10027644]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10063930]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. saliva n.a. PMID[10080645]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10082779]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10084574]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10102915]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[1016232]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10197568]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10214695]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10222355]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10342082]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. 1996-Sep PMID[10352947]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. 1996-Sep PMID[10352947]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10353310]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10379660]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10384376]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10388475]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10400457]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10404733]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10468933]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10487487]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10490504]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. pericardial effusion n.a. PMID[10499868]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10508118]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10509899]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10542053]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10553002]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10553836]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10557354]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10577274]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10577998]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10585175]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10585631]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10588216]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10604139]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10609336]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10622271]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10624837]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10625505]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10625505]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10636262]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10638943]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10649708]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10656535]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10657369]
NPO4795 Prunus armeniaca Species Rosaceae Eukaryota n.a. kernel n.a. PMID[10670815]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10681668]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10683228]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10692117]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10692578]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10698679]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10704102]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10705477]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10722890]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10731506]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10731506]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10759475]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10775436]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10791960]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10828258]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[10833489]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10855991]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10877011]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10887501]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10901139]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10901139]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[1091286]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. breast milk n.a. PMID[10940350]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10946022]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[10947201]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[10960829]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[10977898]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[1100617]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[11007345]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11012668]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[11017945]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11034610]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11034610]
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NPO8255 Cinnamomum aromaticum Species Lauraceae Eukaryota Twigs n.a. n.a. PMID[29883114]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[29897754]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[2994907]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3008371]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[30302998]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3053696]
NPO56725 Micromeria frivaldszkyana Genus Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[30691126]
NPO22258 Chrysanthemum indicum Species Asteraceae Eukaryota Aerial Parts n.a. n.a. PMID[30726671]
NPO23546 Clausena lansium Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[30970599]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3098453]
NPO56906 Nepeta cataria var. citriodora Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31029727]
NPO4579 Nepeta nuda Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31029727]
NPO59388 Nepeta transcaucasica Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31029727]
NPO48128 Nepeta melissifolia Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31029727]
NPO54758 Nepeta sibirica Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31029727]
NPO47856 Ansellia africana Species Orchidaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31140321]
NPO28276 Artemisia argyi Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31181920]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3122251]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3137238]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3137238]
NPO28276 Artemisia argyi Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31418264]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31433178]
NPO4640 Portulaca oleracea Species Portulacaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31625751]
NPO42123 Achillea gypsicola Genus Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31654549]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3179836]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3183053]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[318639]
NPO15373 Actaea dahurica Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[32031796]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3214675]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3243806]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3254164]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[3283102]
NPO20553 Zingiber officinale Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[32872604]
NPO21658 Saccharomyces cerevisiae Species Saccharomycetaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3289762]
NPO63526 Dizygostemon riparius Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[32924270]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3300782]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. amniotic fluid n.a. PMID[3315316]
NPO1493 Hericium erinaceus Species Hericiaceae Eukaryota Fruiting Bodies n.a. n.a. PMID[33246107]
NPO45956 Hibiscus trionum Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[33410569]
NPO27689 Mentha pulegium Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[33502110]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3356699]
NPO59224 Bignonia nocturna Species Bignoniaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[33587821]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3372640]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3373224]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3390913]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3410934]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3432563]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3433275]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3433275]
NPO47856 Ansellia africana Species Orchidaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[34361724]
NPO56717 Thymus atticus Genus Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[34405529]
NPO43317 Thymus leucotrichus Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[34405529]
NPO43560 Thymus perinicus Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[34405529]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[347637]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3515819]
NPO4640 Portulaca oleracea Species Portulacaceae Eukaryota n.a. Along the Valencian coast, Spain 2020-Jun&Jul PMID[35161358]
NPO49049 Calendula incana subsp. maritima Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[35163853]
NPO10932 Melissa officinalis Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[35408950]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3546944]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3572204]
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NPO44665 Achillea coarctata Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36006860]
NPO55060 Ferula macrecolea Genus Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36118048]
NPO54444 Aethionema sancakense Genus Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36144861]
NPO20553 Zingiber officinale Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36352904]
NPO10561 Mentha suaveolens Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36432812]
NPO13275 Centaurea scabiosa Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36501307]
NPO57149 Portenschlagiella ramosissima Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36558905]
NPO18952 Sambucus nigra Species Adoxaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36675004]
NPO15462 Angelica sinensis Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[36838931]
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NPO27689 Mentha pulegium Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37084277]
NPO60874 Jacobaea delphiniifolia Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37104569]
NPO9445 Crocus sativus Species Iridaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37111302]
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NPO14532 Salmea scandens Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37278000]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37446586]
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NPO15462 Angelica sinensis Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37480748]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Species Cladostephaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37504946]
NPO15137 Sideritis scardica Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37509192]
NPO9773 Sideritis raeseri Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37509192]
NPO25518 Hedychium coronarium Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37514241]
NPO18952 Sambucus nigra Species Adoxaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37570937]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37570937]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3757213]
NPO3936 Malva sylvestris Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37726667]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3773351]
NPO18952 Sambucus nigra Species Adoxaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37759401]
NPO46297 Veronica agrestis Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO62636 Veronica anagalloides Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO56756 Veronica austriaca ssp. jacquinii Genus Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO59821 Veronica beccabunga Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO10003 Veronica cymbalaria Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO24939 Veronica officinalis Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37765408]
NPO53087 Epaltes australis Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37819841]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3782411]
NPO10561 Mentha suaveolens Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37836777]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37884443]
NPO23312 Matricaria aurea Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37896017]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3791712]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[3793734]
NPO4633 Calypogeia integristipula Species Calypogeiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37959695]
NPO31303 Solanum lycopersicum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37980871]
NPO58636 Genista tridentata Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[37997986]
NPO16116 Aniba canelilla Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38005295]
NPO58210 Anthemis palestina Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38005810]
NPO56591 Stachys durandiana Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38010960]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3816078]
NPO10932 Melissa officinalis Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38257290]
NPO57119 Eryngium dilatatum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38338307]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38472808]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38498561]
NPO26551 Artemisia ludoviciana Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38543021]
NPO10561 Mentha suaveolens Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38560258]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38681233]
NPO28276 Artemisia argyi Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38754641]
NPO44270 Retama dasycarpa Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38847466]
NPO10942 Retama sphaerocarpa Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38847466]
NPO56591 Stachys durandiana Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38907665]
NPO1085 Peganum harmala Species Nitrariaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38971075]
NPO27689 Mentha pulegium Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38987699]
NPO59831 Verbascum creticum Species Scrophulariaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[38988304]
NPO7175 Eucalyptus robusta Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39064968]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39065529]
NPO57796 Bupleurum praealtum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39124193]
NPO42927 Bupleurum affine Genus Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39124193]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[3918815]
NPO25518 Hedychium coronarium Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39317685]
NPO60022 Lepidium cartilagineum Species Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39321854]
NPO3936 Malva sylvestris Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39382805]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cytoplasm n.a. PMID[3939543]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3944741]
NPO33477 Crithmum maritimum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39455637]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[3958083]
NPO27689 Mentha pulegium Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39633960]
NPO20553 Zingiber officinale Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39679248]
NPO20553 Zingiber officinale Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39680258]
NPO18311 Carthamus tinctorius Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39732883]
NPO59027 Pulicaria burchardii Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[39795328]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[398096]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3988241]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3995762]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[3997054]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[4002227]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cytoplasm n.a. PMID[4025817]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[4030756]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[4030756]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[4038637]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[4055948]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[4055948]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. cerebrospinal fluid n.a. PMID[4073504]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[4086534]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. blood n.a. PMID[415828]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[417892]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[4200890]
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NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. urine n.a. PMID[4430715]
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NPO8874 Glehnia littoralis Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO10449 Arctium lappa Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO2943 Sraitia grosvenorii n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO26378 Bistorta manshuriensis Species Polygonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO14650 Lobelia chinensis Species Campanulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO23213 Bistorta officinalis Species Polygonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO1484 Bupleurum scorzonerifolium Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO784 Sinapis alba Species Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO17072 Lonicera macranthoides Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO4596 Lonicera confusa Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO4795 Prunus armeniaca Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO20297 Arnebia guttata Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO15810 Zea mays Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO15479 Oldenlandia diffusa Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[TM-MC]
NPO8650 Perilla frutescens Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO730 Escherichia coli Species Enterobacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1484 Bupleurum scorzonerifolium Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1515 Lonicera japonica Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15890 Cimicifuga foetida Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO784 Sinapis alba Species Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11438 Angelica gigas Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO23546 Clausena lansium Species Rutaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4795 Prunus armeniaca Species Rosaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3936 Malva sylvestris Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO21345 Lonicera hypoglauca Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2476 Lonicera fulvotomentosa Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11170 Akebia trifoliata Species Lardizabalaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11421 Arnebia euchroma Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8255 Cinnamomum aromaticum Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20440 Chrysanthemum x morifolium Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO25518 Hedychium coronarium Species Zingiberaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2921 Angelica acutiloba Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO23256 Mentha arvensis Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15462 Angelica sinensis Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO25094 Artemisia princeps Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10561 Mentha suaveolens Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1493 Hericium erinaceus Species Hericiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15810 Zea mays Species Poaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19592 Michelia alba Species Magnoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26650 Terminalia chebula Species Combretaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4633 Calypogeia integristipula Species Calypogeiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10492 Artemisia montana Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20297 Arnebia guttata Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19048 Pinellia ternata Species Araceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15137 Sideritis scardica Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14532 Salmea scandens Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13857 Mentha canadensis Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18952 Sambucus nigra Species Adoxaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7510 Ixora chinensis Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29401 Bupleurum chinense Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO28276 Artemisia argyi Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO389 Actaea heracleifolia Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3107 Bupleurum falcatum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10449 Arctium lappa Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16501 Capsicum annuum Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19649 Akebia quinata Species Lardizabalaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO24939 Veronica officinalis Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO27689 Mentha pulegium Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10942 Retama sphaerocarpa Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO22258 Chrysanthemum indicum Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8874 Glehnia littoralis Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16116 Aniba canelilla Species Lauraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29007 Brassica juncea Species Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7175 Eucalyptus robusta Species Myrtaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11100 Artemisia capillaris Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19756 Artemisia mongolica Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10003 Veronica cymbalaria Species Plantaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7255 Pterocarpus indicus Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15373 Actaea dahurica Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11776 Lithospermum erythrorhizon Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13275 Centaurea scabiosa Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4579 Nepeta nuda Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO24492 Tamarindus indica Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9773 Sideritis raeseri Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO23312 Matricaria aurea Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO163 Daucus carota Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7156 Vaccinium myrtillus Species Ericaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17072 Lonicera macranthoides Species Caprifoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10932 Melissa officinalis Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14650 Lobelia chinensis Species Campanulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18311 Carthamus tinctorius Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1085 Peganum harmala Species Nitrariaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO23674 Jatropha curcas Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2727 Actaea simplex Species Ranunculaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26551 Artemisia ludoviciana Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20338 Mus musculus Species Muridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16039 Scutellaria barbata Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9445 Crocus sativus Species Iridaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15479 Oldenlandia diffusa Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1797 Homo sapiens Species Hominidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26378 Bistorta manshuriensis Species Polygonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO21658 Saccharomyces cerevisiae Species Saccharomycetaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26967 Phallus impudicus Species Phallaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP source organism data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated them from below databases:
☉ UNPD: Universal Natural Products Database [PMID: 23638153].
☉ StreptomeDB: a database of streptomycetes natural products [PMID: 33051671].
☉ TM-MC: a database of medicinal materials and chemical compounds in Northeast Asian traditional medicine [PMID: 26156871].
☉ TCM@Taiwan: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 21253603].
☉ TCMID: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 29106634].
☉ TCMSP: The traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform [PMID: 24735618].
☉ HerDing: a herb recommendation system to treat diseases using genes and chemicals [PMID: 26980517].
☉ MetaboLights: a metabolomics database [PMID: 27010336].
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].



  NP Quantity Composition/Concentration

Organism ID Organism Name Organism Material Preparation Organism Part NP Quantity (Standard) NP Quantity (Minimum) NP Quantity (Maximum) Quantity Unit Reference
NPO10003 Veronica cymbalaria Microwave-assisted extraction n.a. 10.81 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO10561 Mentha suaveolens Oil n.a. 0.05 n.a. n.a. % PMID[38560258]
NPO1085 Peganum harmala Headspace n.a. 3.86 n.a. n.a. % PMID[38971075]
NPO10932 Melissa officinalis Oil n.a. 0.3 n.a. n.a. % PMID[35408950]
NPO10942 Retama sphaerocarpa Oil n.a. 2.5 n.a. n.a. % PMID[38847466]
NPO13275 Centaurea scabiosa Oil n.a. 0.35 n.a. n.a. % PMID[36501307]
NPO14532 Salmea scandens Oil Leaves 0.91 n.a. n.a. % PMID[37278000]
NPO15137 Sideritis scardica Oil n.a. 16.42 n.a. n.a. % PMID[37509192]
NPO15137 Sideritis scardica Oil n.a. 2.05 n.a. n.a. % PMID[37509192]
NPO15137 Sideritis scardica Oil n.a. 1.93 n.a. n.a. % PMID[37509192]
NPO15810 Zea mays Raw Husk Essent. Oil 1300 1300 1300 mg/100g Database [DUKE]
NPO15810 Zea mays Raw Silk Essent. Oil 100 100 100 mg/100g Database [DUKE]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.0 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.1 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.3 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.4 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 0.3 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 0.2 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.2 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 0.6 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.7 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 0.7 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO16116 Aniba canelilla Oil n.a. 1.8 n.a. n.a. % PMID[38005295]
NPO18311 Carthamus tinctorius Other Flower 0.122 0.122 0.122 mg/100g Database [DUKE]
NPO18311 Carthamus tinctorius Other Leaf 0.007 0.007 0.007 mg/100g Database [DUKE]
NPO18952 Sambucus nigra Oil Flowers 0.1 n.a. n.a. % PMID[37759401]
NPO18952 Sambucus nigra Oil Flowers 0.3 n.a. n.a. % PMID[37759401]
NPO23312 Matricaria aurea Oil Aerial parts 0.1 n.a. n.a. % PMID[37896017]
NPO23546 Clausena lansium Oil n.a. 0.01 n.a. n.a. % PMID[30970599]
NPO23546 Clausena lansium Oil n.a. 0.03 n.a. n.a. % PMID[30970599]
NPO23546 Clausena lansium Oil n.a. 0.68 n.a. n.a. % PMID[30970599]
NPO24939 Veronica officinalis Microwave-assisted extraction n.a. 3.77 ± 0.03 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Rhizomes 0 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Rhizomes 0.1 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Rhizomes 0.2 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Leaves 0 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Leaves 0.2 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Leaves 0.3 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO25518 Hedychium coronarium Oil Leaves 0.6 n.a. n.a. % PMID[37514241]
NPO26551 Artemisia ludoviciana Oil Aerial parts 0.3 n.a. n.a. % PMID[38543021]
NPO26551 Artemisia ludoviciana Oil Aerial parts 0.1 n.a. n.a. % PMID[38543021]
NPO27689 Mentha pulegium Microwave-assisted hydrodistillation Aerial parts 0.2±0.05 n.a. n.a. % PMID[34328036]
NPO33477 Crithmum maritimum Oil Leaves 0.10 ± 0.06 n.a. n.a. % PMID[38681233]
NPO33477 Crithmum maritimum Oil Leaves 0.13 ± 0.08 n.a. n.a. % PMID[38681233]
NPO3936 Malva sylvestris n.a. n.a. 3.16 n.a. n.a. % PMID[39382805]
NPO42123 Achillea gypsicola Oil n.a. 0.32 n.a. n.a. % PMID[31654549]
NPO42927 Bupleurum affine Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[39124193]
NPO43317 Thymus leucotrichus Oil n.a. 0.5 n.a. n.a. % PMID[34405529]
NPO43560 Thymus perinicus Oil n.a. 0.4 n.a. n.a. % PMID[34405529]
NPO44270 Retama dasycarpa Oil n.a. 2.5 n.a. n.a. % PMID[38847466]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.6 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.3 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.8 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.7 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.4 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 2.9 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO44665 Achillea coarctata Oil n.a. 0.5 n.a. n.a. % PMID[36006860]
NPO4579 Nepeta nuda Oil n.a. 0.08±0.00 n.a. n.a. % PMID[31029727]
NPO45956 Hibiscus trionum Oil n.a. 2.61 n.a. n.a. % PMID[33410569]
NPO46297 Veronica agrestis Microwave-assisted extraction n.a. 11.56 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.18 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.23 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.15 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.12 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.19 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.22 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.24 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.14 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.16 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.10 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO4633 Calypogeia integristipula Oil n.a. 1.09 n.a. n.a. % PMID[37959695]
NPO47617 Echinops polyceras Hydro distillation Inflorescences 0.05 n.a. n.a. % PMID[37241978]
NPO47856 Ansellia africana n.a. n.a. 1.26 n.a. n.a. % PMID[34361724]
NPO47856 Ansellia africana n.a. n.a. 0.03 n.a. n.a. % PMID[31140321]
NPO48128 Nepeta melissifolia Oil n.a. 0.23±0.01 n.a. n.a. % PMID[31029727]
NPO49049 Calendula incana subsp. maritima Oil n.a. 0.08 ± 0.001 n.a. n.a. % PMID[35163853]
NPO53087 Epaltes australis Oil Leaves 0.8 n.a. n.a. % PMID[37819841]
NPO54444 Aethionema sancakense Oil n.a. 3.5 n.a. n.a. % PMID[36144861]
NPO54758 Nepeta sibirica Oil n.a. 0.29±0.02 n.a. n.a. % PMID[31029727]
NPO55060 Ferula macrecolea Oil n.a. 1.35 n.a. n.a. % PMID[36118048]
NPO55150 Grewia bulot Oil Leaves 0.1 n.a. n.a. % PMID[37910669]
NPO56591 Stachys durandiana Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[38907665]
NPO56717 Thymus atticus Oil n.a. 0.2 n.a. n.a. % PMID[34405529]
NPO56725 Micromeria frivaldszkyana Oil n.a. 0.01 n.a. n.a. % PMID[30691126]
NPO56756 Veronica austriaca ssp. jacquinii Microwave-assisted extraction n.a. 13.34 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO56906 Nepeta cataria var. citriodora Oil n.a. 0.05±0.01 n.a. n.a. % PMID[31029727]
NPO57119 Eryngium dilatatum Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[38338307]
NPO57119 Eryngium dilatatum Oil Roots 0.4 n.a. n.a. % PMID[38338307]
NPO57119 Eryngium dilatatum Oil Stems/Leaves 0.1 n.a. n.a. % PMID[38338307]
NPO57149 Portenschlagiella ramosissima Oil n.a. 0.03 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[36558905]
NPO57149 Portenschlagiella ramosissima Hydrosol n.a. 0.86 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[36558905]
NPO57796 Bupleurum praealtum Oil n.a. 0.2 n.a. n.a. % PMID[39124193]
NPO58210 Anthemis palestina Oil n.a. 0.25 n.a. n.a. % PMID[38005810]
NPO58210 Anthemis palestina Oven-dried n.a. 0.14 n.a. n.a. % PMID[38005810]
NPO58210 Anthemis palestina Oven-dried n.a. 0.17 n.a. n.a. % PMID[38005810]
NPO58636 Genista tridentata Oil Flowers 1.8 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO58636 Genista tridentata Oil n.a. 0.3 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO58636 Genista tridentata Oil n.a. 1.2 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO58636 Genista tridentata Oil n.a. 0.4 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO58636 Genista tridentata Oil n.a. 1.4 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO58636 Genista tridentata Oil n.a. 0.6 n.a. n.a. % PMID[37997986]
NPO59027 Pulicaria burchardii Oil n.a. 0.05 n.a. n.a. % PMID[39795328]
NPO59224 Bignonia nocturna Oil n.a. 0.02 n.a. n.a. % PMID[33587821]
NPO59388 Nepeta transcaucasica Oil n.a. 0.20±0.02 n.a. n.a. % PMID[31029727]
NPO59821 Veronica beccabunga Microwave-assisted extraction n.a. 10.73 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO59831 Verbascum creticum Oil n.a. 4.6 n.a. n.a. % PMID[38988304]
NPO60022 Lepidium cartilagineum Oil Flowers 0.49 n.a. n.a. % PMID[39321854]
NPO60022 Lepidium cartilagineum Oil Fruits 2.25 n.a. n.a. % PMID[39321854]
NPO60874 Jacobaea delphiniifolia Oil n.a. 0.08 n.a. n.a. % PMID[37104569]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.39 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.51 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.23 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.49 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.74 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.77 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.46 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 0.34 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Headspace solid-phase microextraction n.a. 2.73 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.08 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.38 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.15 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.24 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.05 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.12 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62378 Cladostephus spongiosus Hydro distillation n.a. 0.14 n.a. n.a. % PMID[37504946]
NPO62636 Veronica anagalloides Microwave-assisted extraction n.a. 9.67 ± 0.01 n.a. n.a. % PMID[37765408]
NPO63526 Dizygostemon riparius Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[37459186]
NPO63526 Dizygostemon riparius Oil n.a. 0.2 n.a. n.a. % PMID[37459186]
NPO63808 Opopanax chironium Oil n.a. 0.1 n.a. n.a. % PMID[37049817]
NPO7156 Vaccinium myrtillus Raw Fruit Juice 0.0003 0.0003 0.0003 mg/100g Database [DUKE]
NPO7175 Eucalyptus robusta Oil n.a. 0.48 n.a. n.a. % PMID[39064968]
NPO9773 Sideritis raeseri Oil n.a. 0.13 n.a. n.a. % PMID[37509192]
NPO9773 Sideritis raeseri Oil n.a. 1.24 n.a. n.a. % PMID[37509192]

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP quantitative records for specific NP domains (e.g., NPS from foods or herbs) from domain-specific databases. These databases include:
☉ DUKE: Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases.
☉ PHENOL EXPLORER: is the first comprehensive database on polyphenol content in foods [PMID: 24103452], its homepage can be accessed at here.
☉ FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].



 Biological Activity

Molecular-level activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference
NPT153 Individual protein Androgen Receptor Homo sapiens Potency n.a. 54947.7 nM PubChem BioAssay data set
NPT163 Individual protein Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Homo sapiens Potency n.a. 61652.4 nM PubChem BioAssay data set
NPT813 Individual protein GABA transporter 1 Mus musculus Activity = 91.0 % PMID[31097402]

In vitro activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference
NPT450 Organism Meloidogyne incognita Meloidogyne incognita EC50 = 167.0 ug.mL-1 PMID[23379671]
NPT450 Organism Meloidogyne incognita Meloidogyne incognita EC100 = 1000.0 mg/L PMID[23379671]
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 1934.6 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 54482.7 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 48972.2 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 54524.5 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 68589.6 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 12301.3 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 10963.5 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 48557.7 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 3066.1 nM PubChem BioAssay data set
NPT2 Others Unspecified n.a. Potency n.a. 68032 nM PubChem BioAssay data set

In vivo activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference





 Experimental ADME

Experiment Model Experiment Tissue ADME Type ADME Relation ADME Value ADME Unit Reference





 Experimental Toxicity

Quantitative toxicity

Experiment Model Experiment Organism Toxicity Type Toxicity Relation Toxicity Value Toxicity Unit Reference
- Rattus norvegicus LOAEL = 400.0 mg/kg-day ToxVal
- Rattus norvegicus NOAEL = 100.0 mg/kg-day ToxVal
- Rattus norvegicus NOAEL = 400.0 mg/kg-day ToxVal
- Rattus norvegicus LOAEL = 100.0 mg/kg-day ToxVal
- Rattus norvegicus NOAEL = 25.0 mg/kg-day ToxVal
- Rattus norvegicus LD50 = 1550.0 mg/kg ToxVal
- Mus musculus LD50 = 3890.0 mg/kg ToxVal
- Mus musculus LC50 = 2.0 mg/L ToxVal
- Oryctolagus cuniculus LD50 > 5000.0 mg/kg ToxVal
- Homo sapiens DNEL systemic = 4.94 mg/m3 ToxVal
- Cavia porcellus LD50 = 3890.0 mg/kg ToxVal

Common Abbreviations:
LC: Lethal Concentration; LD: Lethal Dose; LT:Lethal Time; NOAEL: No-observed-adverse-effect Level; BMDL: Benchmark Dose Lower Confidence Limit; BMD: Benchmark Dose; BMC:Benchmark Concentration; LOAEL: Lowest Observed Adverse Effect Level; RfD:Reference Dose; RfC:Reference Concentration; MRL: Minimal Risk Level; MEG: Maximum Exposure Guideline; PAC: Protective Action Criteria

Categorical toxicity labels

Hepatotoxicity Carcinogenicity Mutagenicity Cardiotoxicity Respiratory Toxicity Eye Irritation Endocrine Disruption
Hepatotoxicity Carcinogenicity Mutagenicity Cardiotoxicity Respiratory Toxicity Eye Irritation Endocrine Disruption

Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP toxicity records from domain-specific databases. These databases include:
☉ ToxValDB: a curated database that compiles quantitative toxicity values for chemicals from diverse public sources to support toxicological research and risk assessment.
☉ TOXRIC: a comprehensive, free-to-access, online database providing toxicological/feature data. The toxicity labels are retrieved from this database. [PMID: 36400569]


  Chemically structural similarity

Similar Active Natural Products in NPASS

Top-200 similar NPs were calculated against the active-NP-set (includes approximately 50,000 NPs with experimentally-derived bioactivity available in NPASS)

Similarity is measured using the Tanimoto coefficient (Tc) , which compares the binary fingerprints of two molecules. Tc is calculated as the intersection divided by the union of '1' bits in the fingerprints, ranging from 0 to 1, with 1 indicating highest similarity.

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC208075 and all remaining natural products in the NPASS database.
●  The right table: Most similar natural products (Tc>=0.5 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Natural Product ID
0.56 Remote Similarity NPC271437
0.55 Remote Similarity NPC65873
0.5417 Remote Similarity NPC285679
0.5238 Remote Similarity NPC246588
0.52 Remote Similarity NPC181786

Similar Clinical/Approved Drugs

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules.

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC208075 and all drugs/candidates.
●  The right table: Most similar clinical/approved drugs (Tc>=0.5 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Drug ID Developmental Stage
NPD

Bioactivity similarity

  Bioactivity similarity

Similar Natural Products in NPASS

Similarity level is defined by Bioactivity similarity was calculated based on bioactivity descriptors of compounds. The bioactivity descriptors were calculated by a recently developed AI algorithm Chemical Checker (CC) [Nature Biotechnology, 38:1087–1096, 2020; Nature Communications, 12:3932, 2021], which evaluated bioactivity similarities at five levels:
☉ A: chemistry similarity;
☉ B: biological targets similarity;
☉ C: networks similarity;
☉ D: cell-based bioactivity similarity;
☉ E: similarity based on clinical data.
Those 5 categories of CC bioactivity descriptors were calculated and then subjected to manifold projection using UMAP algorithm, to project all NPs on a 2-Dimensional space. The current NP was highlighted with a small circle in the 2-D map. Below figures: left-to-right, A-to-E.

A: chemistry similarity
B: biological targets similarity
C: networks similarity
D: cell-based bioactivity similarity
E: similarity based on clinical data