Structure

Physi-Chem Properties

Molecular Weight:  412.37
Volume:  479.432
LogP:  7.26
LogD:  6.388
LogS:  -6.468
# Rotatable Bonds:  5
TPSA:  20.23
# H-Bond Aceptor:  1
# H-Bond Donor:  1
# Rings:  4
# Heavy Atoms:  1

MedChem Properties

QED Drug-Likeness Score:  0.454
Synthetic Accessibility Score:  4.494
Fsp3:  0.862
Lipinski Rule-of-5:  Accepted
Pfizer Rule:  Rejected
GSK Rule:  Rejected
BMS Rule:  0
Golden Triangle Rule:  Rejected
Chelating Alert:  0
PAINS Alert:  0

ADMET Properties (ADMETlab2.0)

ADMET: Absorption

Caco-2 Permeability:  -4.625
MDCK Permeability:  1.284172867599409e-05
Pgp-inhibitor:  0.981
Pgp-substrate:  0.068
Human Intestinal Absorption (HIA):  0.003
20% Bioavailability (F20%):  0.997
30% Bioavailability (F30%):  0.19

ADMET: Distribution

Blood-Brain-Barrier Penetration (BBB):  0.422
Plasma Protein Binding (PPB):  97.58281707763672%
Volume Distribution (VD):  1.54
Pgp-substrate:  2.0927417278289795%

ADMET: Metabolism

CYP1A2-inhibitor:  0.105
CYP1A2-substrate:  0.567
CYP2C19-inhibitor:  0.131
CYP2C19-substrate:  0.928
CYP2C9-inhibitor:  0.3
CYP2C9-substrate:  0.347
CYP2D6-inhibitor:  0.387
CYP2D6-substrate:  0.808
CYP3A4-inhibitor:  0.633
CYP3A4-substrate:  0.655

ADMET: Excretion

Clearance (CL):  6.71
Half-life (T1/2):  0.077

ADMET: Toxicity

hERG Blockers:  0.556
Human Hepatotoxicity (H-HT):  0.179
Drug-inuced Liver Injury (DILI):  0.559
AMES Toxicity:  0.005
Rat Oral Acute Toxicity:  0.006
Maximum Recommended Daily Dose:  0.29
Skin Sensitization:  0.947
Carcinogencity:  0.187
Eye Corrosion:  0.021
Eye Irritation:  0.173
Respiratory Toxicity:  0.749

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General Info & Identifiers & Properties  
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Source Organisms  
Biological Activities  
Similar NPs/Drugs  

  Natural Product: NPC106770

Natural Product ID:  NPC106770
Common Name*:   OSELKOCHBMDKEJ-WGMIZEQOSA-N
IUPAC Name:   n.a.
Synonyms:  
Standard InCHIKey:  OSELKOCHBMDKEJ-WGMIZEQOSA-N
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Synthetic Gene Cluster:   n.a.
ChEMBL Identifier:   n.a.
PubChem CID:   5281326
Chemical Classification**:  
  • CHEMONTID:0000000 [Organic compounds]
    • [CHEMONTID:0000012] Lipids and lipid-like molecules
      • [CHEMONTID:0000258] Steroids and steroid derivatives
        • [CHEMONTID:0002031] Stigmastanes and derivatives

*Note: the InCHIKey will be temporarily assigned as the "Common Name" if no IUPAC name or alternative short name is available.
**Note: the Chemical Classification was calculated by NPClassifier Version 1.5. Reference: PMID:34662515.

  Species Source

Organism ID Organism Name Taxonomy Level Family SuperKingdom Isolation Part Collection Location Collection Time Reference
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. Nigeria(latitude 80°N and longitude 4°E) 2005; 2006 DOI[10.1002/ejlt.201000080]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-010-0259-y]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11306-014-0638-x]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1007/s11746-997-0093-1]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Seeds Anhui province, China DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
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NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Seeds Shandong province, China DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
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NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. DOI[10.1016/j.phytol.2008.07.007]
NPO29147 Hernandia ovigera Species Hernandiaceae Eukaryota n.a. trunk bark n.a. DOI[10.1016/S0040-4039(01)98402-3]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. stem n.a. DOI[10.1021/np50063a031]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. twig n.a. DOI[10.1021/np50063a031]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota Seeds Plovdiv, Plovdiv region in South Bulgaria DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. root n.a. DOI[10.2174/092986712800229032]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[10556916]
NPO25715 Senna siamea Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[10757709]
NPO9909 Sarcophyton crassocaule Species Alcyoniidae Eukaryota n.a. formosan soft coral n.a. PMID[11141104]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11170689]
NPO16456 Mirabilis jalapa Species Nyctaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11277746]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. fruit n.a. PMID[11312782]
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NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota n.a. root n.a. PMID[11395279]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[11408943]
NPO16111 Broussonetia kazinoki Species Moraceae Eukaryota Leaves n.a. n.a. PMID[11575957]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota whole plants Shawnee National Forest, Harrisburg, IL, US n.a. PMID[11678652]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota whole plants n.a. n.a. PMID[11678652]
NPO15773 Ecteinascidia thurstoni Species Perophoridae Eukaryota n.a. Thai n.a. PMID[12088444]
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NPO10443 Sloanea zuliaensis Species Elaeocarpaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[14640532]
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NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota n.a. Brazilian n.a. PMID[15387656]
NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota n.a. ripe fruit n.a. PMID[16205005]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. stem n.a. PMID[16254827]
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NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota n.a. fruit n.a. PMID[16417304]
NPO16560 Palhinhaea cernua Species Lycopodiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[16872152]
NPO9909 Sarcophyton crassocaule Species Alcyoniidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[17067165]
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NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota n.a. branch n.a. PMID[17202693]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[17548953]
NPO25715 Senna siamea Species Fabaceae Eukaryota n.a. leaf n.a. PMID[17685627]
NPO16566 Cinnamosma madagascariensis Species Canellaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[18179176]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota leaves Kaohsiung, Taiwan 2006-SEP PMID[18986201]
NPO16111 Broussonetia kazinoki Species Moraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[19046886]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. Esuela Tecnica Superior de Ingenieros Agrónomos de Albacete 2007 PMID[19256538]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota Fruits n.a. n.a. PMID[19296617]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[19402674]
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NPO21069 Macaranga sampsonii Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. leaf n.a. PMID[19420781]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. root n.a. PMID[19721258]
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NPO17999 Sonneratia alba Species Lythraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[19835393]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[19917748]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[19919095]
NPO13379 Schizanthus tricolor Species Solanaceae Eukaryota Aerial parts n.a. n.a. PMID[20166702]
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NPO11266 Garcinia cambogia Species Clusiaceae Eukaryota n.a. exocarp n.a. PMID[21114277]
NPO13379 Schizanthus tricolor Species Solanaceae Eukaryota n.a. aerial part n.a. PMID[21171571]
NPO22097 Plakinastrella clathrata Species Plakinidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[21261297]
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NPO997 Peltodon longipes Species Lamiaceae Eukaryota roots Santa Maria, South Brazil 2007-Dec PMID[21775156]
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NPO737 Aspergillus japonicus Species Aspergillaceae Eukaryota n.a. latex n.a. PMID[21854017]
NPO27691 Eunicea fusca Species Plexauridae Eukaryota n.a. Caribbean n.a. PMID[21865038]
NPO9189 Streptomyces atratus Species Streptomycetaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[21868221]
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NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[22316191]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[22537213]
NPO27691 Eunicea fusca Species Plexauridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[22734800]
NPO25715 Senna siamea Species Fabaceae Eukaryota Stems n.a. n.a. PMID[23078294]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota flower buds and leaves Khon Kaen province, Thailand 2010 PMID[23270663]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. seed n.a. PMID[23497864]
NPO25715 Senna siamea Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[23513740]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota Leaves n.a. n.a. PMID[23642481]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[23759170]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota Stalks n.a. n.a. PMID[24521157]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[24675423]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. Bako, Ethiopia PMID[24926420]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. Enemore, Ethiopia PMID[24926420]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. Gedo, Ethiopia PMID[24926420]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. Holleta, Ethiopia PMID[24926420]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[25043228]
NPO5119 Pseudomonas chlororaphis Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[25679537]
NPO5119 Pseudomonas chlororaphis Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[25901993]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[25960261]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota Flowers n.a. n.a. PMID[26462418]
NPO24560 Ricinus communis Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[26509914]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. root n.a. PMID[26838074]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. root n.a. PMID[27313650]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. root n.a. PMID[27429639]
NPO13882 Euphorbia grandicornis Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[27731641]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[2778454]
NPO3013 Clathria basilana Species Microcionidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[29094598]
NPO15599 Daldinia concentrica Species n.a. Eukaryota Fruiting Bodies n.a. n.a. PMID[29715021]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Roots n.a. n.a. PMID[29741372]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota Seeds Benedictine Pannonhalma Archabbey, Hungary PMID[29803478]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31433178]
NPO16560 Palhinhaea cernua Species Lycopodiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[31994397]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Seeds HeZe, ShanDong, China early autumn (from August to the beginning of September PMID[32545196]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[32603106]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Roots n.a. n.a. PMID[32951423]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota Seeds Xinjiang,China PMID[33063333]
NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota Fruits n.a. n.a. PMID[33253570]
NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota Seeds n.a. n.a. PMID[3701342]
NPO16455 Xylopia aethiopica Species Annonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[8158166]
NPO29332 Polygala macradenia Species Polygalaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[853371]
NPO17794 Streptomyces violaceusniger Species Streptomycetaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. PMID[8557611]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota n.a. formosan n.a. PMID[8864236]
NPO21926 Pseudomonas aeruginosa Species Pseudomonadaceae Bacteria n.a. Antarctic n.a. PMID[8882433]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[9358644]
NPO2853 Eschweilera coriacea Species Lecythidaceae Eukaryota bark Suriname rainforest n.a. PMID[9677272]
NPO16111 Broussonetia kazinoki Species Moraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. PMID[9917310]
NPO22470 Corynebacterium glutamicum Species Corynebacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. Database[Article]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota Root n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota Fruits n.a. Database[FooDB]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota Seed n.a. n.a. Database[FooDB]
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NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota Seed n.a. n.a. Database[FooDB]
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NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota Bark n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota Fruit n.a. n.a. Database[FooDB]
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NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota Rhizome n.a. n.a. Database[FooDB]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO15294 Magnolia salicifolia Species Magnoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO11228 Fritillaria pallidiflora Species Liliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO11673 Koelreuteria paniculata Species Sapindaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO11842 Petasites laevigatus Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO7541 Ormosia hosiei Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO9798 Paeonia lactiflora Species Paeoniaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO24560 Ricinus communis Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO14575 Periploca forrestii Species Cosmopterigidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO12761 Rheum hotaoense Species Polygonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO26788 Sophora viciifolia Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO13417 Campanula medium Species Campanulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO16101 Gleditsia triacanthos Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO4002 Lappula intermedia Species Boraginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO7322 Plagiochila acanthophylla Species Plagiochilaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO17024 Vitis vinifera Species Vitaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
NPO7132 Smilax glabra Species Smilacaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[HerDing]
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NPO15004 Artemisia taurica Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO25840 Sargassum fusiforme Species Sargassaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18932 Melia azedarach Species Meliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20404.1 Eruca vesicaria subsp. sativa Subspecies Brassicaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11673 Koelreuteria paniculata Species Sapindaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17071 Coeloseira pacifica Species Champiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10877 Humboldtia laurifolia Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO21069 Macaranga sampsonii Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15095 Hippophae rhamnoides Species Elaeagnaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11760 Teucrium orientale Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14002 Petalostemon purpureum Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9909 Sarcophyton crassocaule Species Alcyoniidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4789 Adiantum caudatum Species Pteridaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO29147 Hernandia ovigera Species Hernandiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO7791 Rhododendron makinoi Species Ericaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5719 Hedyotis lawsoniae Species Rubiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16560 Palhinhaea cernua Species Lycopodiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9887 Protohermes grandis Species Corydalidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15301 Tylopilus neofelleus Species Boletaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO22470 Corynebacterium glutamicum Species Corynebacteriaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14909 Artemisia caerulescens Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13417 Campanula medium Species Campanulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12006 Apis mellifera Species Apidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11842 Petasites laevigatus Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14591 Rhabdodendron amazonicum Species Rhabdodendraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO6809 Cailliea cinerea n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15037 Echinops spinosissimus Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5495 Broussonetia papyrifera Species Moraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO1655 Corydendrium parasiticum Species Oceaniidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8359 Phascolosoma vulgare Species Phascolosomatidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO5665 Ulva pertusa Species Ulvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17375 Ceramium botryocarpum Species Ceramiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10770 Ptilota pectinata Species Ceramiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15294 Magnolia salicifolia Species Magnoliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15599 Daldinia concentrica Species n.a. Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14369 Pocillopora eydouxi Species Pocilloporidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4507 Bruguiera gymnorhiza Species Rhizophoraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3375 Cystoseira barbata Species Sargassaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO22097 Plakinastrella clathrata Species Plakinidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17218 Helichrysum nudifolium Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19987 Streptomyces wadayamensis Species Streptomycetaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26988 Acinos thymoides n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13264 Alstonia lanceolifera Species Apocynaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11461 Molopospermum peloponnesiacum Species Apiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9461 Gmelina leichhardtii Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12354 Sargassum pallidum Species Sargassaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15879 Euphorbia nivulia Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17112 Eminium spiculatum Species Araceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13931 Selaginella uncinata Species Selaginellaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3013 Clathria basilana Species Microcionidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO20616 Cichorium spinosum Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO997 Peltodon longipes Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO737 Aspergillus japonicus Species Aspergillaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO19809 Streptomyces roseoviolaceus Species Streptomycetaceae Bacteria n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO24560 Ricinus communis Species Euphorbiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO25715 Senna siamea Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO395 Teucrium pilosum Species Lamiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13379 Schizanthus tricolor Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO10508 Gossypium sturtianum Species Malvaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO6621 Salvadora persica Species Salvadoraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO28868 Pardachirus pavoninus Species Soleidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13095 Pachycereus tehuantepecanus Species Cactaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO84 Isoberlinia angolensis Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO27691 Eunicea fusca Species Plexauridae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16329 Potebniamyces gallicola Species Phacidiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO4095 Hedysarum multijugum Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO8403 Annona coriacea Species Annonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13876 Cedrela salvadorensis Species Meliaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO11266 Garcinia cambogia Species Clusiaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17930 Ambrosia trifida Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16695 Fumaria kraliki Species Papaveraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16455 Xylopia aethiopica Species Annonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO3478 Nelumbo nucifera Species Nelumbonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO26788 Sophora viciifolia Species Fabaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO17145 Aegiceras corniculatum Species Primulaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO13473 Anodendron affine Species Apocynaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2155 Tephroseris integrifolia Species Asteraceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO14575 Periploca forrestii Species Cosmopterigidae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO18560 Tripterospermum japonicum Species Gentianaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2550 Trichoderma citrinum Species Hypocreaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO2584 Monostroma fuscum Species Monostromataceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO15212.1 Fraxinus chinensis subsp. rhynchophylla Subspecies Oleaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO16456 Mirabilis jalapa Species Nyctaginaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO9015 Solanum arundo Species Solanaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]
NPO12761 Rheum hotaoense Species Polygonaceae Eukaryota n.a. n.a. n.a. Database[UNPD]

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP source organism data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated them from below databases:
UNPD: Universal Natural Products Database [PMID: 23638153].
StreptomeDB: a database of streptomycetes natural products [PMID: 33051671].
TM-MC: a database of medicinal materials and chemical compounds in Northeast Asian traditional medicine [PMID: 26156871].
TCM@Taiwan: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 21253603].
TCMID: a Traditional Chinese Medicine database [PMID: 29106634].
TCMSP: The traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform [PMID: 24735618].
HerDing: a herb recommendation system to treat diseases using genes and chemicals [PMID: 26980517].
MetaboLights: a metabolomics database [PMID: 27010336].
FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

  NP Quantity Composition/Concentration

Organism ID NP ID Organism Material Preparation Organism Part NP Quantity (Standard) NP Quantity (Minimum) NP Quantity (Maximum) Quantity Unit Reference
NPO6473 NPC106770 Cold press Seeds 85.8±0.7 n.a. n.a. mg/kg of oil PMID[34645745]
NPO17024 NPC106770 ISO 659, 2009 Seeds 0.5 ± 0.01 n.a. n.a. % DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO17024 NPC106770 ISO 659, 2009 Seeds 0.5 ± 0.02 n.a. n.a. % DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO17024 NPC106770 ISO 659, 2009 Seeds 0.6 ± 0.02 n.a. n.a. % DOI[10.1051/CTV/20163101031]
NPO9798 NPC106770 n.a. Seeds 83.63 ± 1.61 n.a. n.a. mg/100g DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
NPO9798 NPC106770 n.a. Seeds 30.45 ± 1.25 n.a. n.a. mg/100g DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
NPO9798 NPC106770 n.a. Seeds 85.71 ± 2.33 n.a. n.a. mg/100g DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
NPO9798 NPC106770 n.a. Seeds 94.13 ± 2.68 n.a. n.a. mg/100g DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]
NPO9798 NPC106770 n.a. Seeds 72.38 ± 0.95 n.a. n.a. mg/100g DOI[10.1016/j.foodres.2020.109416]

☑ Note for Reference:
In addition to directly collecting NP quantitative data from primary literature (where reference will provided as NCBI PMID or DOI links), NPASS also integrated NP quantitative records for specific NP domains (e.g., NPS from foods or herbs) from domain-specific databases. These databases include:
DUKE: Dr. Duke's Phytochemical and Ethnobotanical Databases.
PHENOL EXPLORER: is the first comprehensive database on polyphenol content in foods [PMID: 24103452], its homepage can be accessed at here.
FooDB: a database of constituents, chemistry and biology of food species [www.foodb.ca].

  Biological Activity

Target ID Target Type Target Name Target Organism Activity Type Activity Relation Value Unit Reference

☑ Note for Activity Records:
☉ The quantitative biological activities were primarily integrated from ChEMBL (Version-30) database and were also directly collected from PubMed literature. PubMed PMID was provided as the reference link for each activity record.

  Chemically structural similarity: I. Similar Active Natural Products in NPASS

Top-200 similar NPs were calculated against the active-NP-set (includes 4,3285 NPs with experimentally-derived bioactivity available in NPASS)

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules. Tc lies between [0, 1] where '1' indicates the highest similarity. What is Tanimoto coefficient

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC106770 and all remaining natural products in the NPASS database.
●  The right table: Most similar natural products (Tc>=0.56 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Natural Product ID

  Chemically structural similarity: II. Similar Clinical/Approved Drugs

Similarity level is defined by Tanimoto coefficient (Tc) between two molecules.

●  The left chart: Distribution of similarity level between NPC106770 and all drugs/candidates.
●  The right table: Most similar clinical/approved drugs (Tc>=0.56 or Top200).

Similarity Score Similarity Level Drug ID Developmental Stage

  Bioactivity similarity: Similar Natural Products in NPASS

Bioactivity similarity was calculated based on bioactivity descriptors of compounds. The bioactivity descriptors were calculated by a recently developed AI algorithm Chemical Checker (CC) [Nature Biotechnology, 38:1087–1096, 2020; Nature Communications, 12:3932, 2021], which evaluated bioactivity similarities at five levels:
A: chemistry similarity;
B: biological targets similarity;
C: networks similarity;
D: cell-based bioactivity similarity;
E: similarity based on clinical data.

Those 5 categories of CC bioactivity descriptors were calculated and then subjected to manifold projection using UMAP algorithm, to project all NPs on a 2-Dimensional space. The current NP was highlighted with a small circle in the 2-D map. Below figures: left-to-right, A-to-E.

A: chemistry similarity
B: biological targets similarity
C: networks similarity
D: cell-based bioactivity similarity
E: similarity based on clinical data